Это был серьезный удар по репутации западногерманских политиков. Замять скандал было невозможно, потянулись рабочие будни следствия. По Западной Германии прокатилась волна обысков. Обыску подверглись 59 квартир и офисов казначеев политических партий. В ходе расследования допросили около 200 свидетелей и возбудили 1800 уголовных дел. Главными подозреваемыми стали три человека: Отто Ламсдорф — бывший министр хозяйства ФРГ, Ганс Фридерихс, его предшественник, и Эберхард фон Браухич — главный управляющий концерна Флика. Ламсдорф оказался на скамье подсудимых за получение от концерна Флика взяток на сумму 165 тысяч марок. Фридерихс обвинялся в получении от Флика 375 тысяч марок. А Эберхарду фон Браухичу было предъявлено обвинение в даче взяток различным политическим деятелям. Суд над обвиняемыми начался 29 августа 1985 года в одном из залов Земельного суда Бонна.
Присутствовавшему на скандальной фотографии федеральному канцлеру также пришлось давать показания, но не суду, а комиссии бундестага по коррупционному скандалу. Протоколы комиссии зафиксировали, что в ходе дачи показаний Коль 79 раз ссылался на провалы в памяти. Он упорно отказывался вспоминать факты дачи взяток, о которых, судя по показаниям свидетелей, просто не мог не знать. В конце концов Коль вспомнил всего о двух-трех конвертах с наличными, полученными от главного управляющего концерна Флика, но взятками их признавать не захотел. К тому же, по словам канцлера, полученные суммы он взял не для себя, а для нужд своей партии — Христианско-демократического союза.
Вскоре выяснилось, что Гельмут Коль был всего лишь продолжателем традиций своих предшественников, в частности — Райнера Барцеля. Этот известный политик, занимавший пост председателя ХДС, а позже руководивший бундестагом, убежденный сторонник «холодной войны», получил от концерна Флика больше всех — один миллион шестьсот тысяч марок.
Соратники Коля также оказались замешаны в коррупционном скандале. Ближайший его сподвижник и второй после него человек в ХДС Альфред Дреггер также получал от Флика пухлые конверты. Еще одним коррупционером оказался Ганс-Дитрих Геншер, долгое время возглавлявший партию Свободных демократов (СвДП) и Министерство иностранных дел ФРГ. За время пребывания в высших эшелонах власти он получил от Флика более миллиона марок. В противоправной деятельности были уличены десятки известных немецких персон. Газеты и журналы восхваляли торжество справедливости и самую крупную за всю историю Германии победу над коррупцией. С легкой руки журналистов нечистых на руку политиков стали изображать в заплатанных фраках (фамилия мультимиллионера Флика в переводе с немецкого означает «заплатка»). Политики отвечали журналистам яростными контробвинениями. Так, Отто Ламсдорф с пеной у рта кричал, что прессу захватили «эскадроны журналистских головорезов, стремящихся морально прикончить неугодных им политиков». Гельмут Коль обвинил журнал «Шпигель» в намерении — ни много ни мало — разрушить государство. Все эти слова выглядели крайне неубедительными по сравнению с добытыми следствием фактами. Но лицам, причастным к раскрытию скандала, пришлось несладко. Один из сотрудников «Шпигеля», господин Кильц, позже вспоминал, что за разоблачение «аферы Флика» его пытались привлечь к суду. А Клауса Ферстера — человека, первым раскрывшего масштабы коррупции правительства ФРГ, уволили со службы в 50-летнем возрасте без пенсионного обеспечения.
Помимо наказания виновных и мести зачинщикам расследования, грандиозный политический скандал имел и другие последствия. В 1986 году высшая судебная инстанция ФРГ — Федеральный конституционный суд — санкционировала открытое финансирование политических партий монополиями. Это беспрецедентное решение вызвало немало споров, однако на самом деле явилось признанием очевидного факта: политика и большой бизнес тесно переплетены друг с другом. И, пытаясь ограничить влияние монополий на политическую жизнь страны, можно добиться противоположного эффекта: прямой дачи взяток высшим руководителям партий.