Определённая избыточность 25-й Системы была понятна уже в начале 60-х годов. Но это было обусловлено стационарностью системы, что делало невозможным манёвр имеющимися силами. Для компенсации этого недостатка вблизи Москвы были развёрнуты дивизионы С-75 и С-125. В то же время на стартовых позициях нескольких полков С-25 были построены объекты противоракетной обороны. Это привело к тому, что в этих полках количество огневых взводов уменьшилось с 10 до 8, но в масштабах общей системы это было некритично.
После развёртывания полков С-200 избыточность 25-й Системы стала очевидна, и в начале 70-х годов полки внутреннего кольца были кадрированы и сняты с боевого дежурства. Но при этом минимальное количество личного состава, необходимое для несения караульной службы и поддержания техники в работоспособном состоянии, в полку сохранялось. Это позволило в середине 80-х годов, когда полки внешнего кольца были сняты с боевого дежурства в связи с перевооружением на С-300, довольно быстро поставить полки внутреннего кольца на боевое дежурство.
Перевооружение на С-300 сделало ненужным бОльшую часть территории стартового дивизиона 25-й Системы и станцию Б-200МР. Поэтому, если дивизион С-300 находился на территории стартового дивизиона С-25, то боевые позиции С-300 огораживались колючей проволокой, а остальная территория оказывалась просто заброшенной. От бесконтрольного проникновения на неё посторонних спасал оставшийся от 25-й Системы периметр и то обстоятельство, что попасть на дивизион можно только по единственной дороге, где стоял КПП.
Территория РТЦ после перехода на С-300 продолжала использоваться. Если полк 25-й Системы становился полком 300-й системы, то в помещении станции Б-200 оборудовался командный пункт полка. Оборудование 25-й системы удалялось, причём обычно его сдавали на техническую базу, но в некоторых случаях просто выбрасывали в ближайший овраг.
Само помещение станции перестраивалось, пробивался дополнительный вход со стороны 1-й группы, и туда ставилась кабина К-9. На месте 5-й группы был сделан склад ЗИП для 300-ки. Также в помещении станции оставался узел связи. Антенны визирования 25-й Системы становились ненужными, их либо демонтировали, либо так и оставляли. Площадку перед антенным павильоном использовали для стоянки автотехники, предварительно заровняв углубления антенн СПК. Рядом с КП полка на вышке ставили антенну радиолокатора.
На РТЦ полков 25-й Системы, которые сменяли дивизионы С-300, помещение станции Б-200 переоборудовали под хранилище запасного боекомплекта дивизиона. Старое оборудование удалялось, пробивались дополнительные входы, обычно со стороны 5-й группы, внутри помещения станции ставились кирпичные перегородки и монтировалась системы кондиционирования. Снаружи новые входы были закрыты стальными гермоворотами. Пакеты с ТПК ставились на тележки и по специальным направляющим лебёдкой затаскивались в хранилище. Оборудование для этого изготавливали из частей пусковых установок 25-й Системы.
Городки полков тоже ждали изменения. Поскольку численность личного состава полка при переходе на 300-ку заметно сократилась, то отпала необходимость в таком количестве казарм. В первую очередь обычно сносили казармы дивизиона – как наиболее ветхие. Но, например, в в/ч 62843 под Киржачом старые казармы сохранились, в 2005 году там снимали художественный фильм «Солдатский декамерон». Если вместо полка С-25 оставалось управление полка С-300, то вместо снесённых казарм строилась новая – панельная двухэтажная. Если вместо полка С-25 ставился дивизион С-300, то в городке ничего не строили, только сносили. Например, в городке в/ч 71548 в Жуковке из капитальных строений казарменной части городка остались только склады, гараж и солдатская столовая из шлакоблоков, а деревянные казармы дивизиона, казарма РТЦ и штаб полка были разобраны ещё в 80-е годы.