Автопилот "семерки" на новом истребителе-бомбардировщике заменили системой автоматического управления САУ-22, снизившей нагрузки на летчика и метеоминимум при лучшей точности исполнительных команд. Она могла демпфировать собственные колебания машины относительно трех осей, стабилизировать ее угловое положение и барометрическую высоту, осуществлять приведение самолета к горизонту (в этом режиме даже при потере летчиком ориентации, к примеру, ночью или в облаках, система из любого положения, даже "на спине", автоматически приводила самолет к горизонтальному полету, удерживая его по крену, тангажу и высоте до принятия летчиком решения). "Обкатку" САУ-22 прошла на опытном самолете С22-11 и других машинах.
Переход на методику прорыва ПВО на малых высотах обусловил появление модернизированной САУ, оснащенной блоком малых высот. Она, помимо прочего, обеспечивала автоматическое управление самолетом на малых высотах над равнинной местностью, стабилизируя истинную высоту полета в пределах 200–500 м при скорости 600-1 100 км/ч по данным радиовысотомера, обеспечивая также увод самолета с опасной высоты.
На истребитель-бомбардировщик установили доработанный бомбардировочный прицел, предназначенный для бомбометания серией или залпом с кабрирования или горизонтального полета при ориентировании по вынесенной точке или по цели, и стрелковый прицел для стрельбы по воздушным и наземным целям, а также для бомбометания с пикирования.
Во всех режимах работы бомбардировочный прицел автоматически определял момент сбрасывания бомб в зависимости от скорости, высоты и угла кабрирования и выдавал сигнал сброса в систему бомбардировочного вооружения самолета. Прибор вырабатывал и индицировал предупредительные и исполнительные сигналы летчику на ввод в кабрирование при сбросе по вынесенной точке (загорание лампочек и звуковые сигналы служили командами на начало маневра). В режиме бомбометания с кабрирования по цели при введении в него данных о ветре (скорость и направление которого устанавливались на земле перед полетом по метеосводке) интегратор прицела вычислял величину и направление бокового пролета для визуального учета поправки на боковой ветер при подходе к объекту атаки с любого направления. Сброс бомб мог осуществляться автоматически в нужный момент или вручную, а запуск прибора выполнялся от кнопки на ручке управления или по радиосигналам с наземного маркерного радиомаяка.
Артиллерийское встроенное вооружение осталось тем же, что и на Су-7: в корнях крыла Су-17 у фюзеляжа размещались две пушки НР-30 с боекомплектом по 80 патронов на орудие, имевшие темп стрельбы 850 выстр/мин на ствол (на 92-й серии левое орудие отсутствовало). Пушки располагались не совсем симметрично — ввиду организации подачи патронных лент правая была смещена назад на 30 см относительно левой, как и их эксплуатационные лючки на крыле; такая особенность была обусловлена размещением патронных лент в рукавах, опоясывающих фюзеляж, передний из которых обеспечивал подачу к левой пушке и задний — к правой, соответственно, и установки орудий были смещены по дистанции примерно на длину патрона (точнее, ширину патронного рукава).