Проблема, поднятая в августовской записке военных, уже обсуждалась учеными на одном из совещаний в Главспецмаше Министерства среднего машиностроения. Мнения ведущих специалистов разделились.
Одни, в их числе были такие столпы ракетной науки как Королев, Келдыш, и Расплетин, считали перехват баллистической ракеты невозможным, и даже называли данную проблему «лженаучной», заявляя: «…это такая же глупость, как стрельба снарядом по снаряду». Другие, наоборот, высказались в поддержку этой идеи. Среди последних был один из ведущих конструкторов С-25 Г.В. Кисунько. Будучи начальником 31-го отдела КБ №1, он занимался волноводами и антеннами. Ему и поручили проработку основных научных вопросов этой системы.
Дабы не мешать развитию различных направлений развития ракетной техники перехвата, КБ-1 разделилось на три СКБ:
СКБ №30 – по разработке системы ПРО, главный конструктор Г.В. Кисунько;
СКБ №31 – разработка зенитных ракет, главный конструктор А.А. Расплетин;
СКБ №41 – разработка авиационных ракет, главный конструктор А.А. Колосов.
Для детальной разработки наиболее сложных элементов системы ПРО решили создать один исследовательский образец, испытать его в полигонных условиях и только после этого перейти к построению настоящей боевой системы. Прототип получил рабочее название «Система А».
Первым делом Кисунько наладил контакт с разработчиками баллистических ракет и лично с С.П. Королевым. По просьбе Кисунько ракетчики стали устанавливать специальные датчики на ГЧ своих ракет, которые позволяли отследить поведение боеголовки после ее отделения от носителя. Вся полученная телеметрия отсылалась для анализа в СКБ №30.
Для обнаружения баллистических ракет требовался специальный радиолокатор. Его начали проектировать В.П. Сосульников и А.И. Берг в НИИ-108.
Кисунько понимал, что существующей аппаратуре не под силу одновременно получать данные от РЛС обнаружения, просчитывать траекторию цели и вырабатывать сигналы наведения для противоракеты. Он решил пойти новым путем и построить комплекс вокруг цифровой ЭВМ, способной решить все эти задачи одновременно и в реальном масштабе времени. Машина разрабатывалась коллективом ученых под руководством академика С.А. Лебедева. Для связи ЭВМ с элементами системы предполагалось создать своеобразную локальную вычислительную сеть.
Разработку противоракеты, при активном участии Д.Ф. Устинова, поручили ОКБ П.Д. Грушина, который ранее работал у Лавочкина и занимался ракетами для комплексов С-25 и С-75. Так как полигонный вариант системы не рассчитывался на перехват цели за пределами атмосферы, то ему поставили задачу разработать обычную зенитную ракету с высокими характеристиками и досягаемостью по высоте не менее 25 км.
Главной изюминкой всей системы «А» стал метод точного определения траектории полета боеголовки, предложенный Кисунько. Он назвал свой метод – методом «Трех дальностей». Его сущность сводилась к следующему. Вокруг защищаемой территории, на равных расстояниях друг от друга (150 км) устанавливались три РЛС. Каждая из них определяла направление на цель и наклонную дальность до цели. По этим данным ЭВМ вычисляла координаты боеголовки в пространстве и направляла на нее противоракету. Ошибка определения координат в этом методе составляла всего несколько метров.
По ту сторону океана работа над «Атласом» также шла с ускорением.
В 1953 г. на фирму «Конвэр» пришел положительный сигнал из Лос- Аламоса – ядерщики сделали «сухую» бомбу весом около 10 т, которую можно было реально поставить в ГЧ «Атласа».
Первый взрыв такой бомбы мощностью 15 Мт прозвучал 28 февраля 1954 г. «Сухая» водородная бомба «Креветка» (Shrimp) неожиданно дала на 9 Мт больше мощности, чем ожидалось. И не удивительно, ведь в нее вложили весь накопленный американский запас Лития-6, обогащенного на 40%. В следующий боеприпас закладывали уже почти природный элемент, обогащенный всего на 7%, и мощность взрыва сильно упала, но «Креветку» запустили в серийное производство.
Боссарт немедленно изменил проект ракеты. В качестве основной была принята полутораступенчатая схема с тремя ЖРД и диаметром корпуса 3 м. Расчетный стартовый вес значительно снизился.