В-2А, участвовавшие в боевых действиях, были оснащены пассивной оборонительной системой радиоэлектронной разведки и управления средствами РЭБ DMS (Defensive Management System) Локхид Мартин Федерал Системе AN/APR-50. Эта в значительной мере компромиссная система была установлена на бомбардировщики вместо «штатного» комплекса РЭБ Нортроп ZSR-62, в полной мере соответствующего принципам технологии «стеле» (его разработка была прекращена по финансовым и техническим причинам еще в 80-е гг.). Система DMS обеспечивает экипаж бомбардировщика информацией о ранее известных средствах ПВО противника, наложенной на цифровую карту местности, что образует геоинформационную систему с указанием зон поражения комплексами противовоздушной обороны в зависимости от профиля полета самолета. Аналогичным образом экипажу предоставляется информация и о вновь обнаруженных в ходе боевого вылета источниках радиолокационного излучения, что позволяет уклоняться от огня малокалиберной зенитной артиллерии и ЗРК, втом числе и при маловысотном полете. Впрочем, последний режим, предназначенный для преодоления мощной российской ПВО, в Югославии не использовался.
Однако характеристики AN/APR-50 далеко не в полной мере удовлетворяют ВВС США. В докладе, подготовленном экспертами Конгресса США по итогам боевого применения В-2А в Югославии, отмечалось, что в ряде случаев система РЭБ «либо неправильно определяла угрозу, либо не обеспечивала точное определение ее местонахождения». А ведь только в 1998 г. она получила усовершенствованное программное обеспечение… Очевидно, дальнейшее совершенствование системы РЭБ станет одним из важнейших направлений модернизации В-2А в XXI веке.
В американской печати приводились кадры, сделанные с борта разведывательного ЛА, на которых изображено восемь капониров одного из аэродромов в Косово. Каждый из них после удара В-2А, сбросившего восемь КАБ, имел по «черному пятну» (пробоине). На другом снимке было показано бетонное укрытие на аэродроме в Приш-тине, разрушенное со стороны передних и задних ворот двумя попаданиями (тоже работа В-2А). Однако большинство боевых самолетов ВВС Югославии благополучно покинули Косово после достижения перемирия, а значит успехи «Спиритов», хотя имели место, но оказались несколько преувеличенными. Скорее всего, причины этого кроются не в недостатках собственно самолета и его комплекса вооружения, а в несоответствии возможностей ударных и разведывательных средств. Это имело место и во время «Бури в пустыне», когда американская разведывательная авиация фактически оказалась не в состоянии обнаружить многие важнейшие цели, в частности, мобильные пусковые установки баллистических ракет. К одному из весьма сомнительных «успехов» В-2А, в значительной степени обусловленному «четкой» работой разведки, следует отнести бомбовый удар по зданию китайского посольства в Белграде, нанесенный тремя КАБ JDAM. Безусловно, совершенствование информационного обеспечения боевого применения стратегических ударных самолетов станет одним из важнейших направлений развития авиации в начале XXI века.
В докладе, подготовленном по заданию Конгресса США, отмечалось, что радиопоглощающие покрытия бомбардировщика имеют относительно низкую износостойкость. Указывалось и на высокую трудоемкость наземного обслуживания, что «снижает возможности ВВС использовать самолеты так часто, как того требует обстановка». Подверглась критике и низкая крейсерская скорость «Спирита» (в реальной обстановке оказавшаяся, очевидно, меньше расчетной). Все эти недостатки также будут поэтапно устраняться в будущем.