Оледенение.
Снеговая линия расположена в Гиссаро-Алае на высоте от 3800 (на З. и Ю.-З.) до 4200—4400Внутренние воды.
Речная сеть развита неравномерно. Наибольшей густотой она отличается в горных областях, наименьшей — на равнинах С. и Ю.-З. Почти все реки относятся к бассейну Амударьи, Сырдарьи и Зеравшана. Только на Восточном Памире небольшие рр. Караджилга, Акджилга, Музкол несут свои воды в бессточное озеро Каракуль, а р. Маркансу принадлежит к бассейну Тарима. Бассейн Амударьи занимаетОзёра расположены главным образом на Памире и в горах Гиссаро-Алая. Самое крупное по площади — озеро Каракуль; озёра Сарезское и Яшилькуль образовались в результате горных обвалов. Одно из красивейших завально-запрудных озёр — Искандеркуль в Гиссарском хребте. Имеются крупные искусственные озёра-водохранилища:
Почвы.
На равнинах и низкогорьях Ю.-З. и С. распространены серозёмы; до высоты 300—600