(По материалам доклада Ивана Сергеевича Гриня на 1-х Свято-Елисеевских образовательных чтениях в городе Новогрудке в 2003 г.)
Археологи М. Каргер, П. Раппопорт, А. Кушнеревич и О. Трусов предполагают, что
Храм возвели за пределами древнего города, на перекрестке дорог. С его появлением сместился и центр города — образовавшаяся перед церковью площадь сделалась его новым центром. Отсюда уходили дороги на Вильню, Вселюб, Минск, Слоним. Строительство этой церкви связывают с правителями Новогрудка XII в. В это время на Замковой горе уже существовала церковь. Решено было построить общедоступный большой храм для всего окрестного люда. Предполагается, что возводили его приглашенные из Витебска и Полоцка мастера вместе со своими местными учениками. Первоначально храм был освящен
С 1317 г. эта церковь получает статус
В XIV в. при этой церкви основан
В 1414-15 гг. в церкви проводились соборы епископов Западной Руси. Они сзывались по указу Витовта. Рассматривался на них, по существу, всегда один и тот же вопрос — об отделении епархии от юрисдикции митрополита Киевского и создании самостоятельной литовской митрополии.
Но раскол был преодолен. Этому посодействовал Московский митрополит святитель Иоанн. Он приезжал в Новогрудок в 1451 г. и прочитал в церкви Пресвятой Богородицы
В 1480 г. церковь посетил епископ Смоленский Михаил. Именно после этого визита церковь стала называться
В 1517-19 гг. на Борисоглебскую церковь пожертвовал князь Константин Острожский. В это время (1507-21) в Новогрудке размещалась резиденция митрополита Иосифа Солтана. Старый храм, поврежденный временем и крымскими татарами, разобрали и на его фундаменте возвели
После Брестской унии 1595 г., когда митрополит Михаил Рогоза подписал унию с католиками, Борисоглебская церковь сделалась униатской. В 1617 базилиане на ее базе соорудили свою резиденцию, а в 30-е гг. XVII в. при церкви образуется и базилианский монастырь, сначала мужской, а потом и женский. Основоположником обоих монастырей был униатский митрополит И.В. Руцкий.
В первой трети XVII в. церковь переоборудовали: ее фасад украсили башни с зубцами и бойницами.
По праву главной церкви Новогрудского деканата, куда входило 35 униатских храмов, Борисоглебская церковь являлась хранительницей и собирательницей основных ценностей здешних храмов. Между прочим, здесь сохранялся престольный восьмиконечный, инкрустированный серебром
Опекунами церкви были магнаты Хрептовичи, Солтаны, Острожские.
14 февраля 1660 г. Иван Александрович Зелены приводил в Борисоглебскую церковь новогрудских шляхтичей присягать на верность царю Алексею Михайловичу.
В 1712 г. городской пожар унес все деревянные постройки, окружавшие церковь.
В 1772 г. церковь отремонтировали. В ее интерьере появился
28 марта 1839 г. Новогрудская Борисоглебская церковь официально вернулась в лоно православия. В том же году она опять становится соборной (центром благочиния).