Осенью 1894 г. Лукьянов реорганизовал отдел сифилидоло гии, созданный Шперком, в отдел общей патологии. Этому предшествовала переписка между принцессой Е. М. Ольденбургской, исполнявшей в указанное время обязанности попечителя ИИЭМа вместо своего супруга А. П. Ольденбургского, и министром внут ренних дел по вопросу об организации в ИИЭМе нового отдела. В письме говорится: «В заседании от 9 сентября с. г. Совет ИИЭМа признал необходимым озаботиться открытием при ин ституте особого научного отдела, посвященного задачам экспе риментальной патологии, под именем “Отдела общей патоло гии”. Существование подобного отдела при институте, носящем название Императорский Институт экспериментальной медици ны, безусловно желательно и необходимо, в пользу чего свиде тельствует между прочим и объяснительная записка к Проекту временного устава и временного штата института. Открытие нового отдела представляется в настоящее время довольно удоб ноосуществимым, ибо, с одной стороны, освободились помеще ния и средства, находившиеся в распоряжении покойного дирек тора института Э. Ф. Шперка, а с другой — в личном составе института имеется специалист, способный руководить разработ кой общепатологических вопросов. Основная задача сифилидо логического отдела, коим заведовал на правах действительного члена института покойный Э. Ф. Шперк, сводится к эксперимен тальному изучению этиологии сифилиса, в качестве таковой эта задача может войти в круг задач и научного отдела общей патологии, заведование коим имеется в виду поручить, на пра вах действительного члена института, нынешнему директору С. М. Лукьянову…» [19].
Лукьянов оставался директором института до 1902 г. и в даль нейшем на него были возложены обязанности попечителя инсти тута в случае отсутствия в столице Ольденбургских. Таким об разом, Павлов в лице Лукьянова, его однокашника и товарища по ВМА, на протяжении многих лет имел «своего человека» в Совете ИИЭМа.
В отделе Павлов и его сотрудники продолжали вести иссле дования пищеварительной системы. Как известно, уже в первой половине 90х гг. был установлен факт «художественной гар монии» деятельности пищеварительных желез в отношении различных видов пищи. В 1894 г. усилиями Павлова и П. П. Хи жина (1852—1909) была отработана операция маленького изо лированного желудочка, что дало возможность подробно ис следовать деятельность желудка непосредственно во время пищеварительного процесса и получать чистый желудочный сок. Необходимо отметить, что Хижин, ученик московского хирурга и физиолога В. А. Басова, был земским врачом, прекрасным хи Краткий очерк жизни и деятельности И. П. Павлова 573 рургом и ранее, да и после блестящей защиты диссертации «От делительная работа желудка собаки» (1895) на степень доктора медицины работал главным врачом больницы, которую на свои средства открыла Е. М. Ольденбургская в своем имении в город ке Рамонь Воронежской губернии.
Материалы исследований по физиологии пищеварения были представлены Павловым в цикле лекций, прочитанных им в 1895 г. для научной и медицинской общественности в конфе ренцзале отдела биохимии ИИЭМа. Первая лекция состоялась 16 февраля. С марта он приступил к чтению этих же лекций для всех желающих в ВМА в пользу малоимущих студентов. Лек ции — важный этап систематизации обширных физиологиче ских данных о нервной регуляции деятельности пищеваритель ных желез, о закономерностях отделения пищеварительных соков, о взаимодействии секреторной деятельности желудка с работой печени, поджелудочной железы, тонкого кишечника и других частей пищеварительного тракта. Павлов показал, что, широко используя экспериментальную хирургию в хронических опытах на животных, можно исследовать взаимоотношения в ра боте пищеварительных желез и закономерности их деятельности.
Новое направление в изучении пищеварения — исследование физиологических механизмов деятельности пищеварительных желез в условиях хронического эксперимента на здоровом жи вотном, при сохранении целостной и непрерывной работы же лудочнокишечного тракта — обширные экспериментальные данные — Павлов представил в книге «Лекции о работе главных пищеварительных желез», опубликованной в 1897 г. по реше нию Конференции ВМА. К семи прочитанным лекциям в книге была добавлена восьмая — «Физиологические данные, инстинкт людей и медицинский эмпиризм». В 1898 г. вышло немецкое издание.