В последние годы жизни Александра III, то есть в 1892-1894 гг., между Германией и Россией разразилась таможенная война. До 1891 г. вся германская промышленность пользовалась в России всевозможными льготами и большинство германских товаров проходило без всяких пошлин. Никаких торговых договоров между Россией и Германией не существовало. Однако в 1891 г. Россия ввела новый таможенный тариф, который предусматривал индивидуальное налогообложение для каждого ввозимого из-за границы товара. Главной целью этих мер было создание своей собственной национальной промышленности. В ответ на русский новый тариф Германия ввела два вида пошлин на сельскохозяйственные продукты: максимальные и минимальные. Причём Германия заявила, что ко всем тем державам, с которыми она имеет торговые договоры, будут применяться пошлины минимальные, а к тем державам, с которыми не заключено торговых договоров, будут применяться максимальные пошлины. Так как Россия не имела с Германией торговых договоров, то к ней сразу применили пошлины максимальные. Берлин ввёл высокие пошлины на сельскохозяйственные продукты из России и главным образом на ввозимый русский хлеб. Петербургу был поставлен ультиматум: отменить действия нового тарифа. Однако Россия не поддалась германскому шантажу и в свою очередь повысила ввозные пошлины на германские уголь, металл и машины. В результате Берлин был вынужден пойти на уступки, однако торговые противоречия между двумя империями продолжали существовать.
Антагонизм между Россией и Германией был вызван не только геополитическими противоречиями. Не менее важной причиной была духовно-идеологическая основа Второго рейха. Ещё начиная с 1848 г. в Пруссии всё более усиливается роль либеральных идей и франкмасонства. Собственно, оно всегда имело в Германии прочные позиции. Король Фридрих Великий был членом ордена Иллюминатов и имел звание гроссмейстера Великой ложи "Трёх Глобусов". Уже во времена Фридриха масонский фактор использовался для борьбы с Россией. Находясь под контролем масонских организаций Пруссии, русские масоны становились своего рода подданными прусского короля, мечтавшего о разгроме и расчленении России. Фридрихом планировалось не только отстранение от власти императрицы Елизаветы Петровны, но и военная интервенция в России8. Участие России в Семилетней войне было обусловлено, в том числе, масонской опасностью, исходившей от прусского трона. Высшее прусское масонство по своим каналам было тесно связано с молодым русским масонством и всячески опекало его. Сложилась система неформальных связей, которая для многих русских масонов становилась предпочтительнее, чем служение России.
Следует отметить, что германское масонство в целом, и прусское в частности, было тесным образом связано с масонством английским. Именно из Англии масонство пришло в Германию. Первый немецкий масон, владетельный граф Альбер Вольфган Шаумбург-Липпе, вступил в ряды "братства" в масонской ложе в Лондоне. До 30-х гг. XVIII в. все немецкие масоны должны были ездить на заседания английских лож. Только в 1733 г. английские старшие "братья" разрешили немцам самим открывать ложи в германских государствах. Через ложи Англия весьма сильно влияла на Пруссию вплоть до конца XIX в. Во время франко-прусской войны 1870-1871 гг. Лондон поддерживал прусского короля масона Вильгельма I, ставшего в 1871 г. императором объединённой Германии. Масоном был и преемник Вильгельма I, его сын император Фридрих III, отец Вильгельма II.
Англо-германские масонские связи были установлены на самом высоком уровне, в том числе и династическом. В 1840 г. английская королева Виктория вышла замуж за принца Альберта Саксен-Кобург-Готского. Ещё до женитьбы Альберт вступил в студенческую аристократическую корпорацию "Боруссия", несомненно, масонского характера; в неё же вступит и его внук Вильгельм II. Старший сын Альберта принц Альберт Эдуард, будущий король Эдуард VII, был великим мастером объединённой Великой ложи Англии, его внуки, Эдуард VIII и Георг VI, были мастерами Шотландской ложи.