Отряд был подчинен начальнику разведывательного отдела штаба Краснознаменной Амурской флотилии капитану 2-го ранга Борису Назаровичу Бобкову. В недавнем прошлом комиссар-подводник, активный участник войны с белофиннами и Великой Отечественной войны, опытный, мудрый и храбрый разведчик, чрезвычайно требовательный, но справедливый начальник, Борис Назарович Бобков пользовался у офицеров отдела и у всех разведчиков отряда огромным уважением и непререкаемым авторитетом. Он лично участвовал в подборе бойцов при формировании разведотряда, много занимался боевой и политической подготовкой разведчиков в период становления подразделения, приложил много сил, ума, творческого опыта при разработке боевых задач, которые пришлось выполнять разведчикам с началом войны. Разведчики называли его между собой «батей», хотя по возрасту тогда он был не старше некоторых из них.
Командиром отряда был назначен капитан Степан Матвеевич Кузнецов — флагманский специалист штаба флотилий по физической подготовке. По характеру человек очень спокойный, уравновешенный, волевой и, как показали боевые действия, смелый, решительный, а когда требовалось — осторожный.
Перед началом боевых действий заместителем командира разведотряда, а по совместительству переводчиком был назначен старший оперативный офицер агентурного отделения разведотдела лейтенант Тарский Юрий Самсонович. Он имел опыт разведывательной работы и прилично владел китайским и английским языками, а также определенным минимумом японского.
Основную массу бойцов отряда, насчитывавшего 45 человек, составляли матросы и старшины — амурцы, в большинстве своем уроженцы Приамурья, Алтая, Сибири. Почти все они в годы войны служили на Дальнем Востоке, боевым опытом не обладали, но страстно рвались в бой и горели патриотическим желанием поскорее положить конец Второй мировой войне. Немалую роль играло также естественное стремление молодых людей показать свою отвагу и смелость, доказать фронтовикам, что и они, вынужденные стоять в годы войны заслоном против врага на Востоке, способны сражаться за свою Родину не хуже героев Великой Отечественной войны.
Следует отметить, что при подборе личного состава отряда обращалось самое серьезное внимание на физические данные и физическую подготовку кандидатов, умение владеть оружием, хорошую вазимотор-ную реакцию.
Ядром отряда стала группа опытных разведчиков — старшин, сержантов и матросов, прибывших после окончания боевых действий с Северного и Черноморского флотов. Группа североморцев, воевавших в отряде Героя Советского Союза В.Н. Леонова и имевших большой боевой опыт, была более многочисленной и состояла из 9 человек. Ее прибытие оказало существенное влияние как на боевую подготовку отряда, состоявшего в основном из личного состава, не имевшего боевого опыта, так и на дальнейшие действия разведчиков в ходе боевых действий. '
В отряде было 5 членов партии. Парторг—старшина 1-й статьи Дмитриев. Все остальные были комсомольцами. Комсорг отряда — матрос А. Меньшов, а его заместителем был старшина 1-й статьи В. Коротких.
Вооружение разведотряда было штатным: 3 станковых, 4 ручных пулемета системы Дегтярёва, автоматы ППШ, ручные гранаты Ф-1, РГД-5, ПТ.
Из нештатного вооружения имелись 3 автомата «шмайссер», один — «суоми» и 4 пистолета «маузер».
Весь личный состав отряда перед началом боевых действий был переодет в армейское обмундирование солдатского образца без знаков отличия. Однако все без исключения моряки разными путями ухитрились оставить, припрятав, тельняшки, а некоторые — и бескозырки. В бой все шли, надевая под гимнастерки тельняшки, и никакие приказы не могли помешать этому. Впрочем, если быть честным до конца, то следует признать, что командир отряда и его заместитель делали то же самое.
На начальном этапе предварительная боевая подготовка бойцов отряда мало чем отличалась от подготовки солдат армейских частей, но постепенно она усложнялась, в нее вводились все новые специфические элементы, связанные с выполнением разведывательно-поисковых и диверсионных задач, методами десантирования с кораблей, катеров, с воздуха, действиями отряда как штурмового подразделения. Отрабатывалось взаимодействие отделений и одиночных бойцов.
Одиночной подготовке разведчиков отводилась весьма значительная роль, при этом особое внимание обращалось на владение средствами связи, умение стрелять из личного оружия, из станковых и ручных пулеметов, пользоваться оружием противника. Четыре бойца были подготовлены к вождению автотранспортных средств, в том числе и японских. При подготовке отряда практиковались длительные марши и марш-броски, практическое десантирование в условиях сильного противодействия противника. Для тактической подготовки командиров отделений и бойцов был оборудован стол-макет местности, на котором проигрывались различные варианты действий на определенных участках местности.