Поход Ермака положил начало движению русских в Зауралье. В Сибирь отправлялись военные отряды, которые строили там города, способные выдержать натиск неожиданных нападений. В 1585 г. возникла крепость Тюмень, в 1587 г. – Тобольск, ставший русским центром Сибири.
Кучум в 1598 г. потерпел сильное поражение и вскоре погиб в степях Средней Азии. В течение нескольких десятилетий борьбу с русскими продолжали его дети и внуки – «кучумовы дети».
В последнее десятилетие XVI в. в состав России вошли земли по реке Оби – от Иртыша до Обской губы. В восточной ее части, в глубине «студеной тундры», был построен Мангазейский городок, ставший крупнейшим торговым центром Сибири. В Сибирь устремился поток торговых людей, спасавшихся от растущего крепостнического гнета.
Хозяйственное развитие страны требовало выхода в Балтийское море. Страна для преодоления отсталости нуждалась в активизации торговли, в усилении политических и культурных связей со странами Западной Европы. В завоевании Прибалтики, где властвовал Ливонский орден, были заинтересованы феодалы, стремившиеся к получению новых земель. Обеспечив безопасность своих восточных границ, Россия приступила к решению балтийского вопроса.
Во второй половине XVI в. сложилась благоприятная международная обстановка. В 30-40-е годы Польша, Ливония и Швеция старались закрыть для России выход на Балтику. Ливонский орден стремился не допускать развития отношений России с европейскими странами. Весьма часто Ливония не пропускала в Россию иностранных мастеров, особенно сведущих в артиллерии и военном деле, нанятых московским правительством. Одним из поводов к войне и послужила очередная задержка Ливонским орденом более ста специалистов из стран Западной Европы, приглашенных для службы в Россию. Еще одним поводом к войне стала неуплата Ливонским орденом в течение 50 лет дани за город Юрьев (Дерпт, совр. Тарту).
Ливония представляла собой скорее географическое, чем политическое понятие. Там существовали три политические системы – Ливонский орден, церковь и города. Очень часто даже по важнейшим вопросам они не могли договориться между собой. Кроме того, в Ливонии нарастали социальные противоречия. Латышские и эстонские крестьяне были крепостными немецких феодалов и несли в их пользу тяжелую барщину. Эстонцы и латыши в городах подвергались притеснениям со стороны немцев, входивших в городскую верхушку. Социальные противоречия самым тесным образом переплетались с национальными. Слабевший год от года Ливонский орден не представлял собой грозного соперника для России.
Гораздо опаснее были планы шведского короля Густава Вазы, прилагавшего усилия для создания антироссийского союза в составе Швеции, Дании, Польши и Ливонского ордена, чтобы не допустить выхода России на побережье Балтики. Шведы хотели присоединить русские земли в бассейне Невы, Ладожского озера и южного побережья Финского залива. Предполагалось совместное нападение на русские земли со стороны Финляндии и со стороны Прибалтики и Польши. Но в середине 50-х годов эти планы остались неосуществленными из-за обострившихся противоречий между Швецией и Данией. В это время Россия могла не опасаться нападений крымских татар, так как в Крыму свирепствовал голод и бескормица.
Воспользовавшись весьма выгодной для России ситуацией, Иван IV в январе 1558 г. начал войну с Ливонским орденом. Русские войска вступили в северо-восточную часть Ливонии. В мае после непродолжительной осады была взята мощная крепость Нарва, что открыло русским войскам путь в Эстляндию. Затем был взят Дерпт. В 1559 г. русские войска подошли к Риге и вышли на левый берег Западной Двины. В 1560 г. были взяты ливонские крепости Мариенбург и Феллин. Русские войска заняли почти всю территорию Ливонии, выйдя к берегам Балтики. Фюрстенберг, магистр Ливонского ордена, который развалился под ударами русских полков, был пленен.
Выхода России на Балтику не желали допустить Швеция, Дания, Польша. Поэтому они приступили к разделу земель Ливонии. В 1559 г. польский король Сигизмунд II Август подписал с новым магистром ордена Кетлером, за уступку Польше земель по среднему течению Западной Двины, договор о защите Ливонии. Дания захватила остров Эзель (Сааремаа). В 1560 г. Швеция захватила Ревель (Таллин) и всю северную Эстонию. Было образовано Курляндское герцогство, объявленное светским государством, во главе с магистром ордена Кетлером. Таким образом, в борьбе за Прибалтику вместо Ливонского ордена Россия столкнулась с тремя сильными европейскими государствами – Швецией, Данией, Польшей, что и предопределило дальнейший ход войны.