На противоположных позициях стояли ученые-материалисты И. М. Сеченов, И. И. Мечников, Н. А. Умов, Н. Н. Бекетов, развивавшие материалистическую философию на почве естествознания, а также прогрессивные культурные деятели Украины, прежде всего выдающиеся революционные демократы И. Я. Франко, П. А. Грабовский и др. Их философские взгляды формировались на почве социальной проблематики и опирались на материалистические традиции философии Н. Г. Чернышевского, Н. А. Добролюбова.
Ученые-материалисты рассматривали идеалистическую философию как попытку теоретически оправдать религию. Своими трудами естествоиспытатели-материалисты наносили ощутимые удары по идеалистическим теориям. Революционные демократы, принадлежавшие к материалистическому направлению в философии, уделяли в своих произведениях особенно большое внимание проблемам социального прогресса, гуманизма и атеизма. Материалистическое направление в науке укреплялось с проникновением в философию марксистских идей.
В острой идеологической борьбе происходило развитие общественно-экономической мысли на Украине. Основной экономической проблемой пореформенного периода оставался аграрно-крестьянский вопрос. К его решению представители противоположных идеологических направлений относились по-разному. Передовая экономическая мысль отражала интересы крестьянства. Ее вершиной в домарксистский период были общественно-экономические взгляды Т. Г. Шевченко, который требовал отмены крепостного права, бесплатного наделения крестьян землей, призывал к крестьянской революции.
На позициях утопического социализма стояли революционные народники. В идеологии либерального народничества утопический социализм превращался в мещанский радикализм. На Украине это направление в экономике представлял Н. В. Левитский. Революционные демократы И. Я. Франко, П. А. Грабовский, Леся Украинка в своих произведениях, высказываниях раскрывали причины и формы капиталистической эксплуатации, популяризировали отдельные идеи марксизма.
Новый этап в развитии экономической науки начался с проникновением на Украину идей марксизма, в частности экономического учения К. Маркса, изложенного им в «Капитале». На Украине распространялись труды одного из основателей группы «Освобождение труда» Г. В. Плеханова, в которых характеризуется процесс капиталистического развития экономики России в пореформенный период. Первые произведения В. И. Ленина, написанные в 1893–1899 гг., в которых много места отводится анализу экономических процессов на Украине, представляли собой вершину развития марксистской экономической науки конца XIX в.
Разработка экономических проблем осуществлялась также на кафедрах политэкономии и статистики Киевского, Харьковского и Новороссийского университетов дворянско-буржуазными учеными — представителями официальной идеологии. В своих научных исследованиях они отражали интересы торгово-промышленной и сельскохозяйственной буржуазии. Известным представителем этого направления был буржуазный теоретик-экономист Н. X. Бунге. В 1870 г. он издал курс лекций «Основы политической экономии», в которых излагал вульгарные теории стоимости и капитала, пропагандировал экономические идеи Мальтуса, выступал сторонником принципа частной собственности на средства производства. Следующий труд Н. X. Бунге «Очерки политико-экономической литературы» (1895) также написан с позиций восхваления капитализма. На более прогрессивных позициях стоял профессор политэкономии Харьковского университета Г. М. Цехановецкий, который в своих лекциях неоднократно освещал различные вопросы экономической теории К. Маркса, хотя в целом относился к ней критически. Среди ученых-экономистов выделилась группа, которая представляла либерально-народническое направление в буржуазной политической экономии. К ней принадлежал профессор Новороссийского университета А. С. Посников. В своих исследованиях «Начала поземельного кредита», «Общинное землевладение» он защищал народнические идеи о необходимости сохранения общинного землепользования и возможности избежать капиталистического развития в России.
С обострением классовой борьбы и распространением в России произведений основоположников марксизма даже в центрах официальной науки — университетах возрастал интерес к марксистскому экономическому учению. Наряду с преподавателем Киевского университета Н. И. Зибером интерес к экономическому учению К. Маркса проявляли отдельные ученые Харьковского университета. Оставаясь в общем на позициях буржуазной политэкономии, они соглашались с рядом марксистских положений. М. М. Коссовский даже выступал в защиту К. Маркса против нападок консервативных буржуазных ученых Б. Н. Чичерина и Н. X. Бунге.
Разновидностью либерально-буржуазного направления в экономической науке был «легальный марксизм», представителями которого на Украине были Б. А. Кистяковский и Н. В. Водовозов. С середины 90-х годов «легальные марксисты» стали на путь прямой ревизии марксизма.