Значительное внимание Центральный комитет КП(б)У уделял созданию и деятельности частей особого назначения (ЧОН), в мае 1920 г. включенных в систему Всевобуча. С целью централизации управления было создано единое командование ЧОН и Всевобуча. К осени 1920 г. в республике насчитывалось 18 территориальных полковых округов Всевобуча, в которые входили и части ЧОН. В то время как Красная Армия вела напряженные бои на фронтах, ЧОН вместе с органами ВЧК и милиции боролись с кулацко-националистическими бандами и другими контрреволюционными элементами.
Активное участие в борьбе с внутренней контрреволюцией принимали рабочие и трудящиеся крестьяне. В ряде мест из членов комитетов незаможных селян и сельских активистов создавались с этой целью вооруженные отряды. Уезды и волости, в которых особенно активно действовали кулацкие банды, объявлялись на военном положении.
Принятые Коммунистической партией и Советским правительством Украины срочные меры по борьбе с бандитизмом, активное участие трудящихся республики в наведении революционного порядка позволили укрепить тыл Юго-Западного фронта. К середине лета 1920 г. был ликвидирован ряд кулацких банд и обезврежены многие агенты контрреволюции.
Благодаря бдительности органов ЧК и особых отделов воинских частей были ликвидированы подпольные националистические центры — так называемые повстанческие комитеты в Жмеринке, Полтаве, Лубнах, Лохвице, Конотопе. Принимались меры по прекращению враждебной деятельности меньшевиков, правых эсеров и других антисоветских партий и группировок.
Организация большевистского подполья и партизанского движения.
Коммунистическая партия Украины и политические органы воинских частей и соединений Юго-Западного фронта уделяли большое внимание делу разложения войск противника, а также организации большевистского подполья в оккупированных районах. На Подолии и Волыни еще до общего наступления белопольских войск была создана сеть подпольных большевистских организаций. В начале апреля 1920 г. на Подолии функционировало восемь подпольных организаций, в том числе в Проскурове, Волочиске, Каменце-Подольском, Могилеве-Подольском и др.; на Волыни — 16 подпольных организаций (в Шепетовке, Ровно, Луцке, Изяславе, Староконстантинове, Дубно, Здолбунове, Ковеле и др.). Руководство партийным подпольем здесь сначала осуществляли Подольский и Волынский губкомы партии и Зафронтбюро при штабе 12-й армии. В конце мая с целью централизации подпольной работы Зафронтбюро по поручению ЦК КП(б)У создало тройку для руководства большевистским подпольем на всем Правобережье. В ее распоряжение были выделены опытные работники, необходимые материальные средства. Партийная тройка разделила оккупированную территорию на четыре района, куда были направлены группы подпольщиков, установила систему явок, наладила связь.26 мая 1920 г. Оргбюро ЦК КП(б)У приняло решение о создании в составе ЦК КП(б)У на базе Зафронтбюро Заграничного отдела во главе с Ф. Я. Коном.
Загранотдел координировал свою военную работу с работой штабов 12 и 14-й армии, где имелись его уполномоченные. ЦК КП(б)У непосредственно руководил деятельностью Загранотдела. Политбюро заслушивало его отчеты, оказывало помощь в подборе кадров для подпольной работы, организации издательского дела и т. д. Издавалась газета «Жолнеж польский», выпускались листовки, распространявшиеся среди солдат польской оккупационной армии. К концу июня 1920 г. вышло 12 номеров газеты тиражом 240 тыс. экземпляров. Кроме того, было издано 28 различных воззваний и листовок общим тиражом около миллиона экземпляров. Всего на Юго-Западном фронте с 15 мая по 1 ноября 1920 г. было издано и распространено более 5 млн. экземпляров газет, брошюр, воззваний, листовок. Все это способствовало росту среди польских солдат антивоенных настроений, симпатий к Советской стране.
Большое внимание подпольные большевистские организации уделяли созданию партизанских отрядов и вооруженным выступлениям против оккупантов. Боевые партизанские отряды были сформированы на Подолии, Волыни, Киевщине. Только в Каменец-Подольском уезде коммунисты создали несколько партизанских отрядов. Самый большой из них, численностью более 100 человек во главе с Ф. И. Топольницким, базировался в районе г. Смотрич. Йод руководством члена Каменец-Подольского ревкома коммуниста Мишенина действовал партизанский отряд в районе Гуков — Марьяновка. Был создан местными коммунистами вооруженный отряд и в самом Каменце-Подольском. В условиях жестокого террора оккупантов в городе состоялась уездная нелегальная партийная конференция, наметившая меры по активизации работы во вражеском тылу. Партизанский отряд, действовавший в Изяславском уезде, в начале июля 1920 г. взорвал два эшелона с оружием и польскими войсками, отправлявшимися на фронт. На Волыни коммунисты-подпольщики создали вооруженные отряды в районе местечек Пятки и Чудново. И в самом Житомире активно действовали подпольщики, проводившие агитационную и разведывательную работу.