Причиной неудач советских войск на Крымском фронте было прежде всего то, что его командование не приняло необходимых мер для создания надежной, глубокоэшелонированной обороны. Силы фронта были растянуты в одну линию, не имели необходимых резервных частей. Как отмечалось в приказе Ставки, неудачи на Крымском фронте объяснялись в значительной мере еще и тем, что его командование (командующий фронтом генерал Д. Т. Козлов и член Военного совета Ф. А. Шаманин) не сумело организовать взаимодействия армий с наземными и воздушными силами. Потеряв управление войсками, командование фронта отдавало приказы, не зная положения на фронте. Военный совет вместо конкретного руководства войсками терял время на многочисленные и бесплодные заседания. Значительная вина за поражение лежала на представителе Ставки армейском комиссаре Л. З. Мехлисе.
Несколько частей и подразделений советских войск, прикрывавших отступление основных сил через Керченский пролив, были отрезаны от берега. Героическую борьбу с фашистскими захватчиками они продолжали партизанскими методами в районе каменоломен Аджимушкая (ныне — Партизаны, предместье Керчи). Там же находились раненые и обслуживающий персонал госпиталей, не успевшие эвакуироваться жители преклонного возраста, женщины и дети.
Борьбу защитников Керчи в каменоломнях возглавили полковник П. М. Лгунов и батальонный комиссар И. П. Парахин. Люди находились в тяжелых условиях. Не было света и воды. Продуктов хватило всего на несколько дней. От голода и жажды умирали дети и раненые. Мужественные советские патриоты делали частые вылазки и нападали на врага. Фашисты в нескольких местах сделали подкопы и взрывами обвалили часть катакомб, но не сломили противодействия. Тогда, вопреки существующему международному праву, они применили отравляющие газы. Закрыв все выходы, фашисты стали компрессорами нагнетать в катакомбы хлор, бросать туда дымовые шашки.
24 мая 1942 г. подземный гарнизон послал в эфир радиограмму: «Внимание! Внимание! Внимание! Всем! Всем! Всем! Ко всем народам Советского Союза! Мы, защитники города Керчи, задыхаемся от газа, умираем, но в плен не сдаемся. Лгунов».
Силы героев Аджимушкая таяли. Погиб полковник П. М. Лгунов. Оборону катакомб возглавил командир танкового полка подполковник Г. М. Бурмин. Несмотря на большие потери, трудности и неимоверные страдания, гарнизон продолжал мужественно бороться. Отдельные группы бойцов и командиров держались еще почти полгода, вплоть до ноября 1942 г. В ноябре героический гарнизон под руководством Г. М. Бурмина и И. П. Парахина сделал отчаянную попытку с боем прорваться в Старокрымские леса к партизанам. В неравной борьбе многие воины пали смертью героев. Многие попали в плен, где их ожидали расстрелы, пытки, страшные мучения фашистской неволи. Лишь отдельные бойцы и офицеры добрались в расположение партизанских отрядов.
Аджимушкайские катакомбы, где в 1942 г. 15 тыс. советских воинов и трудящихся Керчи почти полгода оказывали мужественное сопротивление фашистским захватчикам, стали непокоренной крепостью в тылу врага. Участники этой борьбы стоят в одном ряду с героическими защитниками Брестской крепости. Указом Президиума Верховного Совета СССР от 14 сентября 1973 г. Керчи присвоено почетное звание «Город-Герой» с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда».
После поражения советских войск на Керченском полуострове ухудшилось положение защитников Севастополя. Враг получил возможность сосредоточить против них все силы 11-й армии. Гитлеровцы имели здесь превосходство в людях — в 3 раза, орудиях и минометах — почти в 4, танках — в 13 и авиации — в 12 раз. С 20 мая по 1 июня вражеская артиллерия и авиация наносили удары по городу и тылам советских войск, а со 2 по 7 июня — непосредственно по их позициям. В городе возникло много пожаров, которые нечем было тушить: водопровод не работал. Но врагу не удалось деморализовать население и вывести из строя военные объекты. Связисты, электрики, пожарники, бойцы МППО, ремонтно-восстановительные бригады, медицинские работники делали невозможное, устраняя разрушения. Героическая борьба продолжалась.