Во Франции король Генрих III Валуа в ноябре 1574 г. дал свое согласие на объединение тамошних каноников Св. Гроба с орденом Св. Иоанна, в соответствии с решением Ватикана. Однако многие французские рыцари Гроба Господня отказались выполнить волю папы римского и своего собственного короля! Причем сепулькриеры ссылались на то, что их орден был основан не папой, а предводителем 1-го Крестового похода Готфридом Бульонским (церемониальный меч, использовавшийся французскими сепулькриерами при посвящениях в рыцари Гроба Господня, считался ими – как когда-то иерусалимскими канониками Гроба Господня! – мечом самого Готфрида).
Факт столь вопиющего неподчинения говорил, между прочим, о крайней слабости королевской власти в тогдашней Франции, раздираемой междоусобной войной между католиками и протестантами-кальвинистами, вошедшими в историю под названием гугенотов (это название являлось искажением немецкого слова «айдгеноссен», Eidgenossen – самоназвания швейцарских конфедератов, распространивших во Франции новую веру своего религиозного учителя Жана Кальвина).
Первое французское братство рыцарей Гроба Господня было основано еще в начале XVI в. в Париже. К вступлению в него допускались не только лица дворянского происхождения, но и заплатившие достаточно крупный денежный взнос горожане (причем в орден можно было вступить и по доверенности!).
Так, гражданин Марселя Жан Буазон был посвящен в рыцари Гроба Господня по доверенности за своего друга Франсуа Серси, никогда не совершавшего паломничества в Иерусалим! В 1615 г. группа французских рыцарей Гроба Господня избрала Великим Магистром ордена Шарля де Гонзага, герцога Неверского (ставшего в 1627 г. суверенным герцогом Мантуанским).
Рыцарям папской ветви ордена Гроба Господня Ватикан пожаловал целый ряд привилегий – титул палатина, или пфальцграфа (лат.: comes palatinus), старшинство над членами всех прочих рыцарских орденов, кроме ордена Золотой Шпоры (Золотого Рыцарства) и ордена Золотого Руна; право узаконивать внебрачных детей (!), изменять данные им при крещении имена, миловать осужденных на смерть на пути к эшафоту. Кроме того, папы пожаловали рыцарям «своего» ордена Гроба Господня право присоединять орденский «иерусалимский» крест к своим родовым гербам и именоваться во всех официальных документах рыцарями Св. Гроба Господня.
В 1847 г. папа римский Пий IX даровал латинскому Патриарху Иерусалимскому право посвящать достойных кандидатов в рыцари Св. Гроба от имени папы.
После нескольких предпринимавшихся в дальнейшем (неудачных) попыток преодоления раскола и воссоздания единого ордена Св. Гроба только папе Пию IX удалось в 1868 г. создать стабильное объединение рыцарей Св. Гроба, поставив его под прямое папское управление, и даровать ему статус папского рыцарского ордена Римской Церкви. Этот орден был всецело подчинен римскому папе как верховному главе всех христиан-католиков. С этого момента все члены ордена Св. Гроба Господня стали подразделяться на три класса, или ранга:
1) великих рыцарей;
2) комтуров (командоров);
3) рыцарей.
Эмблемой ордена по-прежнему оставался древний красный «иерусалимский» усиленный крест с четырьмя крестиками поменьше по бокам.
Благодаря усилиям рыцарей ордена Св. Гроба удалось реконструировать и расширить резиденцию католического патриарха Иерусалимского и латинской патриаршей церкви в Иерусалиме. Католический патриарх Иерусалимский Валерга незадолго до своей смерти добился от папы римского Пия IX полномочий на дарование званий и инсигний (знаков принадлежности к ордену) рыцарей ордена Св. Гроба Господня не только мужчинам, но и женщинам за выдающиеся заслуги в деле распространения римско-католической веры в Земле Воплощения.
Папа римский Лев XIII подтвердил эти полномочия патриарха Иерусалимского в своем Апостолическом послании от 3 августа 1888 г. В этом же послании он даровал принятым в орден кавалерственным дамам почетный титул «матрон Святого Гроба» (лат.: matronae Sancti Sepulcri). Лишь сравнительно недавно они стали именоваться не матронами, а дамами Святого Гроба.
Годы понтификата папы Льва XIII (1878–1903) ознаменовались значительным увеличением численности рыцарей ордена Гроба Господня, особенно за счет притока новых членов в Италии и Франции. При нем по образцу древних орденов рыцарей-крестоносцев были организованы многочисленные национальные ассоциации рыцарей и матрон в форме землячеств.
В Германии численный рост ордена Св. Гроба Господня некоторое время сдерживался так называемым культуркампфом (борьбой германского имперского канцлера князя Отто фон Бисмарка против влияния католической церкви, которую он считал враждебной интернациональной силой, препятствующей прочному объединению Германии).