Юстиниан I восстановил разрушенные стены Херсона. Это подтвердили археологические раскопки. Были реконструированы ключевые узлы городской оборонительной системы. В портовом районе в V–VI вв. построили вновь куртины XXV и XXVI и башню 23 на их стыке (рис. 3). Необходимую для данных работ известь гасили в известковой яме выкопанной рядом с куртинами. На ее дне найдена монета Юстиниана I. Стены башни поставлены на слой глины специально насыпанный на песчаный грунт (Антонова И.А.
, 1996, с. 116, 188). В глинистом слое внутри башни содержались фрагменты светлоглиняных и коричневоглиняных с сужением корпуса амфор, известных в Херсонесе с VI в. (Антонова И.А., 1971, с. 104; Романчук А.И., Сазанов A.B., Седакова Л.В., 1995, с. 16–20) (табл. 23, 3, 4, 7). Судя по керамике, извлеченной из нивелировочной засыпи в районе юго-восточного участка обороны, строительные работы здесь проводились во второй четверти VI в. (Голофаст Л.А., 1996, с. 77–78). Тогда же осуществили четвертую перестройку главной городской башни (рис. 3, 17б). В забутовке четвертого строительного периода находились фрагменты светлоглиняных амфор типа Якобсон 1 и монета Юстиниана I (Стржелецкий С.Ф., 1969, с. 21, 23, рис. 2). Одновременно отремонтировали куртину, примыкающие к ней башни XVII/I и XVIII (Антонова И.А., 1976, с. 5–7).На западном участке, присоединенном к городу в начале VI в. (рис. 3), был создан новый оборони тельный узел (табл. 24, 1
). Первоначально, в начале VI в., его оградили стеной, к которой пристроили хозяйственное помещение (1). Одновременно соорудили рыбозасолочную цистерну. Через некоторое время возвели прямоугольную башню (1б) и удвоили толщину куртины I. Вдоль них в материковой скале начали вырубать широкий и глубокий ров (табл. 24, 1, 2), но строители, наткнувшись на своем пути на несколько больших позднеримских склепов (табл. 24, 2) оставили ров незавершенным. Из накопившегося у куртины первого слоя и из нижней части засыпи рва извлекли монеты Юстиниана I и краснолаковые североафриканские миски со штампованными крестиками и птицами (Антонова И.А., 1963, с. 63; 1990, с. 21).Весьма сложно реконструировать топографию города VI в. Многие раннесредневековые дома уничтожили строители IX–XIV вв. Судя по выявленным во всех его районах остаткам жилых и хозяйственных помещений, производственных объектов VI в., Херсон унаследовал от античности планировку прямоугольными кварталами с прямыми улицами с канализацией и водопроводом из глиняных труб. Его главная улица длиной около 1 км и шириной 6–7 м пересекала город с юго-запада на северо-восток (Якобсон А.Л.
, 1964, с. 19). Археологические раскопки зафиксировали крупные строительные работы, производившиеся в годы правления Юстиниана I на всей территории города. По мнению А.Л. Якобсона, юстиниановский город отличался от позднеантичного, во-первых, более плотной застройкой, а во-вторых, доминированием возведенных в тот период базилик (Якобсон А.Л., 1959, с. 131, 285). С 1950-х годов ведется реставрация городских базилик и храмов. В процессе новых раскопок и предреставрационного изучения их фундаментов стен и полов установлено, что большинство базилик и два крепостных храма построили не в VI в., а позднее. Лишь несколько крупных базилик возвели в интересующий нас период.Западную базилику, входящую вместе с часовней, крестообразным зданием и часовней-усыпальницей в единый культовый комплекс, возвели на присоединенной к городу территории (табл. 24). С началом строительства базилики, ограду участка укрепили вторым поясом и засыпали цистерну (Антонова И.А.
, 1963, с. 61, 63). Постройка базилики и реконструкция стены датированы по монетам Юстиниана I и керамике не ранее второй четверти VI в. Базилика трехнефная, с большим залом с двумя колоннадами из девяти колонн, полукруглой внутри и пятигранной снаружи апсидой, нартексом и, видимо, вторым открытым нартексом (табл. 25, 1). К ее южной стороне примыкает галерея с апсидой. Пол среднего нефа вымощен мраморными плитами, а полы боковых нефов покрыты мозаикой. Видимо, у базилики было стропильное перекрытие с черепичной кровлей. В перевязь с восточной частью северной стены здания возведена прямоугольная крещальня с широкой апсидой. К ней в значительно более позднее время пристроен крестообразный мавзолей с усыпальницей. Рядом расположена одноапсидная часовня. С культовым комплексом связан склеп, высеченный в незавершенном рву у первой куртины (табл. 24, В). Его закрывала закладная плита с крестом с раздвоенными концами и надписью VI–VII вв. — «Да упокоишь здесь, Господи, раба божьего Гота» (Голофаст Л.А. и др., 1991, с. 30, № 15; Яйленко В.П., 1987, с. 168).