Немало времени Дзержинский уделял работе особых отделов, проводя в жизнь необходимость централизации чекистского аппарата. После 5 июля 1921 г. он писал Менжинскому: «Неподчинение Особому Отделу ЮгоЗапу фронта Особ. Отд. Черноморского и Азовского морей считаю неправильным. При неподчинении Особ. Отд. Юго-Зап. фронта — Морск. Особ. Отд. он обязательно выродится. При отсутствии фактического контроля при неподчиненности Ос. Отд. Юго. Зап. фронта конфликты Морского Ос. Отд. с 00 13 и 14 армиями, а также с губчека неизбежны. Разделить борьбу за шпионаж на морскую и сухопутную — бессмыслица, а посему предлагаю выработать проект предложения о соподчиненности Морского Особ. Отд. Черного и Азовского морей в своей деятельности от грузинской границы до Таганрога Особ. Отдела Кавказского фронта, а от Таганрога до Днестра — Особ. Отд. от Кавказского фронта Юго-Зап. фронта и командованию морским силами в духе аналогичном взаимоотношениям 00 ВЧК и командованию отдельным фронтом»[514]
.25 декабря 1921 г. Дзержинский снова писал Манцеву о важности не столько реорганизации, сколько упразднения особых отделов, считая, что особое существование ЧК и Особого отдела при отсутствии внешних фронтов — «доведет до драки и упадка. По-моему, в конечном счете, Ос. от. не должно быть. Персональная уния на верху не решает вопроса…Ужасно туго идет объединение, товарищи все друг друга «лучшие» особотделисты и вечекисты. А если объединения не произойдет, упразднят нас быстрее, чем это нужно. Сейчас положение таково, что какой-нибудь инцидент, даже мелкий, может вызвать крупные последствия. Каждый «обиженный» станет «обличителем». Но черт с этим. Пишу это не для нытья, нам нужно сейчас напрячь силы для перестройки, для избежания справедливых нареканий, быть на чеку. Злюсь на себя, что в связи с некоторыми перипетиями сам я расхлябался и несколько нервничаю». Органы ВЧК на местах, по мнению председателя ВЧК, должны быть едины, их базой является местная власть, и только там, где есть особые политические соображения, не следует передавать всей власти местным советским органам, а можно оставлять особые отделы для свободы действий центральной власти. Но представителем центральной власти по линии ВЧК должен быть ее представитель, он же начальник всех ЧК. — «Теперь это нетрудно было бы сделать вхождением Фрунзе в Совнарком». И Дзержинский предложил следующую схему построения чекистского аппарата: «Цупчерзком — единый и единственный орган ВЧК на Украине, Ос. от. не пщ Цупчр., а Цупчрезкома (как и у нас ни при ВЧК, а просто ВЧК). Никаких окружных Ос. от. (Какая их база? Окрвоенком?). Если нужно, при окрвоенкоматах могут быть уполномоченные нач. Цупчрезкома с правами, определяемыми не Конституцией, а Вашими полномочиями. Каждая губчека имеет там, где нужно, свой Ос. от. На случай военных действий и необходимости образовать армейские Ос. от. (подвижные, а не территориальные, приспособленными для войны, а не мира) должен быть мобилизационный план, уже сейчас составляемый.
Несмотря на эти мои взгляды, я приказ Ваш подпишу, ибо моя схема должна быть тенденцией, провести ее сразу трудно при не определившемся еще достаточно военном положении запада Украины и из-за персональных соображений. Ваши соображения[515]
.В 1921 г. была улучшена организационная структура органов ВЧК на транспорте. 3 марта из подчинения войск ВЧК выведены железнодорожная и водная милиция, 27 июня, в соответствии с административным делением речного и морского транспорта, реорганизованы ТЧК. В первую очередь были созданы водные отделы при Петроградской, Южной, Кавказской, Сибирской ОКТЧК и ЮгоЗападной ДТЧК[516]
. Выступая на совещании представителей ВЧК, Центрального Комитета транспорта (ЦекТрана) и НКПС 17 мая с докладом о реорганизации ТЧК и их роли на транспорте, Дзержинский отметил, что принципы организационного строения ТЧК и транспорта должны совпадать, и главная задача ТЧК помогать НКПС, а борьба с контрреволюцией не может быть специализированной, ибо она «едина и ее нельзя подразделять на железнодорожную и гражданскую…»