С учетом серьезности этих данных, по указанию П. Судоплатова, «Кампфгруппе «Эдельвейс» была взята в активную оперативную разработку. В течение февраля разведчики резидентуры установили место дислокации штаба и центра подготовки агентов и диверсантов, выявили ряд личных оперативных связей Ф. Тгуна, которые использовались им для получения информации о партизанском движении в Словакии. В дальнейшем с участием самого С. Морозова была осуществлена вербовка агента «Д» и ряда других источников, через которых в последующем удалось получить подробные данные не только на штатный состав спецгруппы, но и шпионов, засланных в партизанские отряды, а также предотвратить покушение на подполковника Егорова.
Наряду с агентурным проникновением в гитлеровские спецслужбы резидентурами осуществлялись дерзкие боевые акции по уничтожению самих центров подготовки шпионов и диверсантов. По своим масштабам они скорее напоминали настоящие войсковые операции. Только в ходе одной из них, спланированной и блестяще проведенной 23 декабря 1944 года руководителями РДР «Олимп» в районе словацкого города Кошице, была полностью ликвидирована гитлеровская специальная школа, в которой готовились диверсанты и террористы для заброски в тыл Красной армии.
Кроме того, РДР Управления приходилось выполнять и другие специфические задачи. В частности, специальные боевые группы В. Карасева, Н. Прокопюка, Е. Мирковского, С. Ваупшасова, действовавшие под глубоким прикрытием власовцев или местных националистов, устанавливали контакт, а в некоторых случаях «объединялись» с ними якобы для совершения совместных действий. В результате такого взаимодействия двум оперативным группам из РДР «Охотники» и «Олимп» всего за три месяца 1944 года удалось ликвидировать 212 и захватить живьем 221 командира и боевика. В большинстве своем, как отмечал П. Судоплатов в одном из своих докладов руководству НКВД, подобные операции проводились «почти без потерь с нашей стороны».
Значительное место в работе РДР занимала деятельность по организации национального партизанского движения и разложению личного состава частей противника. Опираясь на национальные кадры, которые составляли большинство в РДР «Горные», «Авангард» и «Верные», они осуществляли активную агитационную и пропагандистскую работу. В этих целях издавались не только листовки, но и газеты на национальных языках, которые затем распространялись среди местного населения и военнослужащих противника. Целая подпольная типография действовала в резидентуре «Верные». На ее базе «для разоблачения лживой пропаганды немцев, вовлечения населения в партизанскую борьбу, разложения гарнизонов противника и конспирирования группы» печаталась на словацком языке газета «Морго». Всего было выпущено 48 номеров общим тиражом 16 187 экземпляров.
Наряду с ней широко распространялись агитационные листовки на венгерском и немецком языках. В результате, как отмечал в своем отчете руководитель РДР майор государственной безопасности С. Морозов, «мужское население деревень в районе дислокации отряда стало уходить в горы, вступать в отряд или просто прятаться от немцев. Влияние это стало сказываться и среди воинских частей противника, которые стали разлагаться и переходить на сторону партизан. Из различных частей только в опергруппу перешло 64 человека. Всего было сформировано 6 отрядов.
Для разложения военнослужащих противника и склонения к переходу на сторону партизан разведчики резидентур использовали старый и испытанный способ — агентурное проникновение в воинские части и морально-психологическую обработку командиров. В ходе последующей оперативной работы целые подразделения в полном составе, с вооружением и техникой переходили на их сторону.
Так, через своего агента в гарнизоне Словенская Люнча руководители резидентуры «Горные» вышли на контакт с венгерскими офицерами одной из артиллерийских частей гарнизона. В процессе дальнейшей оперативной и агитационной работы им удалось склонить не только командиров, но и весь личный состав к переходу на свою сторону. По ее итогам капитан государственной безопасности Волков Николай Варсонофьевич кратко сообщил в Центр: