Академик Иоффе к 1942 г. превратился в крупнейшего чиновника от науки и совершенно не понимал перспектив развития атомной физики, тем более ее инновационных технических аспектов. Из-за своего незнания ядерной проблематики он крепко подставил своего друга Капицу, порекомендовав его Сталину в руководители «Атомного проекта». Вождь тут же организовал небольшое совещание, где, к своему несказанному удивлению, услышал от Кентавра, что военные атомные технологии не имеют особых перспектив. Иоффе был страшно смущен, но после писем Флерова (будущий академик Георгий Николаевич Флеров в 1942 г. написал два письма Сталину, где доказывал, что немецкие и американские ученые начали интенсивно работать над ядерными боезапасами) деваться ему было некуда, и после нескольких неудачных попыток во главе проекта был поставлен Игорь Васильевич Курчатов. Сталин же при свидетелях заметил, что если Капица неправ, то он лишится своего института.
Хотя Петр Леонидович очень тяжело переживал свою вынужденную отставку с поста директора института, он ни на мгновение не изменил своим научным и нравственным принципам. Главным из них была непрекращающаяся творческая деятельность, всегда и в любых условиях, и в этом смысле, как впоследствии выяснилось, у академика Капицы существовала серьезная «домашняя заготовка». Это был очень своеобразный научный проект, который преследовал две весьма амбициозные цели: во-первых, показать, что он может придумать вещи пострашнее атомной бомбы, а во-вторых, благодаря собственному таланту и изобретательности разработать их буквально, как говорят радиоэлектронщики и прочие умельцы, «на коленях», в домашних условиях. Вот в этих условиях Петр Леонидович и занялся так называемой электроникой больших мощностей.
…Если вместо школы в несколько учеников я создал большой исследовательский институт, если я ставил и разрешал вопросы серьезного теоретического и практического значения, то это, конечно, не моя личная заслуга. Подготовленный до некоторой степени условиями… я попал в русло революции, и потом уж только активное участие в величайшей в истории человечества задаче построения социализма сделало меня сознательным ее работником.
Начало этим исследованиям положил проект известного советского радиофизика и конструктора Н. И. Кабанова, предложившего идею раннего загоризонтного обнаружения летательных аппаратов в диапазоне коротких волн на удалении в несколько тысяч километров. Он обнаружил, что зондирующие лучи при длине волны от 10 до 100 м в принципе способны, отразившись от ионосферы, облучить цель и возвратиться по тому же пути к РЛС.
Прежде всего тут требовалось сверхмощное радиоэлектронное оборудование, и теоретические расчеты Ландау ясно указали экспериментаторам оптимальный путь.
Сначала академик Капица приступил к оборудованию на своей подмосковной даче, расположенной на Николиной Горе, личной лаборатории, которую он назвал с язвительным подтекстом «избой физпроблем». Несколько лет Кентавр вел замкнутый образ жизни, выезжая в Москву только для чтения лекций в МГУ. Правда, к опальному директору иногда приезжали посетители. В основном это были его бывшие сотрудники, среди которых встречались институтские рабочие высочайшей квалификации, способные создавать сложнейшие лабораторные приборы и установки. Регулярно бывал на даче своего бывшего шефа и Ландау. Именно он рассказывал в своем теоротделе, как «изба физпроблем», под которую Капица выделил обширный сарай, превращается в самую настоящую небольшую частную лабораторию наподобие тех, которые Ландау видел во время своих давних загранкомандировок.
Все, что делал у себя на Николиной горе академик Капица, до сих пор окутано тайнами и легендами. Есть среди них полуфантастические и просто фантастические. Так, можно услышать, что когда строптивый академик не явился на празднование 70-летия «отца народов», его не только изгнали из МГУ, но и отключили его дачу от электроэнергии.