Комиссия поставила вопрос и о некотором улучшении снабжения флота. Так, она предложила установить, что наряды на уголь для траления должны выдаваться особо, отдельно от нарядов на учебные цели морских сил. Это решение было вызвано установившейся практикой сокращения нарядов на уголь для флота, а так как сокращение траления было невозможно, то остальные силы флота страдали особенно сильно, подготовить доклад в РВСР о заводах, необходимых для судоремонта и «обратить внимание Главснабпродарма на снабжение Кавказской армии и Кавказской (Каспийской
В ноябре 1921 года Л. Д. Троцкому поступила записка от начальника Морских сил Черного моря Э. С. Панцержанского, в которой, в частности, автор отмечал, «отсутствие единого и согласованного для всех флотов плана политической работы благодаря недостаточному вниманию к флоту со стороны центральных политических органов». При этом Панцержанский проанализировал ситуацию не только до, но и после Кронштадтского мятежа. Из его оценки следовало, что руководство наркомата по военным и морским делам не сделало из произошедших событий должного вывода, а ограничилось «взрывом дешевой демагогии в отношении всех моряков» и в переложении «виновности в государственных преступлениях отдельных лиц командного состава на всю корпорацию остатков бывшего кадрового офицерства». Кроме этого, Э. С. Панцержанский высказывал претензии к огульному увольнению моряков под видом фильтрации и об определении корабельного состава флота, исходя из предельной численности продовольственных пайков для личного состава, а не из задач, стоящих перед РККА.
В начале 1922 года была учреждена «Особая правительственная комиссия, назначенная для выяснения и разработки мероприятий по улучшению состояния Балтийского флота и Кронштадтской крепости» в составе В. А. Антонова-Овсеенко, С. А. Мессинга и В. Комарова. Ее предложения были одобрены на заседании Совнаркома 22 октября 1922 года. Комиссия предлагала повысить жалованье военнослужащих в Кронштадте на 10 % и еще на 10 % за счет «поясного повышения», кроме этого, ввести 25 % надбавку за плавание (к плавсоставу были приравнены гарнизоны островных фортов). Кроме этого, предлагалось ввести дополнительную 25 % надбавку за службу более одного года, а также дополнительную 10 % надбавку за службу на тральщиках и подводных лодках. Таким образом, общая сумма надбавок могла дойти до 80 % от основного оклада.
Данные мероприятия, а также весьма жесткая партийная чистка 1921 года серьезно укрепили партийные организации флота и способствовали некоторому повышению дисциплины личного состава. Однако полностью переломить настроение матросской массы они так и не смогли. Матросы прибавку к жалованью, разумеется, одобрили, но в своем большинстве вели себя точно так же, как и раньше: независимо и своевольно.
Для того чтобы кардинально переломить ситуацию в РККФ, необходимы были экстраординарные меры. И они были найдены!
Официально считается, что взять шефство Российскому коммунистическому союзу молодежи (комсомолу) над флотом посоветовал лично В. И. Ленин. И хотя документальных подтверждений этому нет, в принципе, столь здравая идея вполне могла прийти в голову именно Ленину, который всегда отличался неординарным мышлением. Действительно идея была гениальная. Шефство комсомола над флотом в реальности означало перенесение фронта борьбы с революционными матросами внутрь самого флота. Ведь до этого времени старые матросы 1917 года быстро и легко «обращали в свою анархистско-матросскую веру» всех молодых призывников. Авторитет старых революционеров в тельняшках магически действовал на малообразованную сельскую (и мало чем от нее отличавшуюся, окраинно городскую) молодежь. Попадая в Кронштадт, эти вчерашние доверчивые ребята буквально за несколько месяцев становились заправскими «иванморами», с широченным клешем и ухватками старых марсофлотов. И хотя море (а точнее, восточную оконечность Финского залива) они видели только с причалов кронштадтской Усть-Рогатки, во всем остальном они полностью подражали своим старшим товарищам. Проходило еще немного времени – следовал новый призыв, и картина в точности повторялась. После кронштадтских событий в Кремле пришли к выводу, что сколько ни расстреливай старых матросов, новые призывники, попадая в атмосферу вольнолюбивого Кронштадта, быстро восполнят все понесенный братвой потери. И вот В. И. Ленин, сам или по чьему-то мудрому совету, решил одним махом навсегда остановить эту бесконечную карусель матросского воспитания.
Теперь вместо политически неграмотных городских и сельских парней на флот должны были идти исключительно комсомольцы. Причем далеко не все, а только самые активные и политически грамотные, уже сделавшие определенную комсомольскую карьеру, умевшие выступать и агитировать, и прошедшие проверку на большевистскую преданность.