Упорство, с каким «бакинцы» отстаивали свои взгляды, повлияло на руководство партии во главе с Лениным. В 1911 г. по решению руководства РСДРП была создана Российская организационная комиссия (РОК) по созыву VI Общепартийной конференции. В состав комиссии вошли такие видные деятели БК, как Шаумян и Спандарян, а также Орджоникидзе. В состав РОКа вошли и такие подпольщики, как питерский рабочий-токарь И. С. Белостоцкий, член тифлисской организации большевиков Е. Д. Стасова и другие.
Фактически РОК стала новым общепартийным центром и свое первое совещание открыла в Баку 29 сентября 1911 г. Однако в первый же день работы был арестован Шаумян. В связи с этим РОК перенесла свою работу в Тифлис. РОК обратилась с призывом ко всем партийным организациям, всем партийцам «всемерно содействовать делу возрождения нашей партии, немедленно выбирать делегатов на партийную конференцию, возрождать социал-демократию на местах». Деятельность РОКа встретила сопротивление среди эмигрантских кругов РСДРП, представленных в Заграничной организационной комиссии по созыву конференции (ЗОК). Споря с представителями ЗОКа, Орджоникидзе заявлял: «Если вы, оторванные от России, потеряли всякую способность оказывать поддержку русской работе, то, по крайней мере, не мешайте нам… Я же, как уполномоченный Российской организационной комиссии, заявляю, что ничего общего с этим обломком заграничного учреждения не имею».
Итогом работы РОК стала VI конференция РСДРП, созванная в Праге. Благодаря стараниям РОКа организации РСДРП были представлены таким образом, что среди делегатов конференции оказались почти сплошь большевики. Меньшевистских делегатов было лишь двое – Д. М. Шварцман и Я. Д. Зевин. (Шварцман был избран в ЦК в качестве единственного представителя меньшевиков. Зевин впоследствии стал одним из «26 бакинских комиссаров»). Столько же делегатов на конференцию «направила» и царская охранка. Среди делегатов-большевиков двое, представлявших Центральную промышленную область (Малиновский и Романов), были тайными агентами полиции.
О возросшем влиянии «бакинцев» свидетельствовало то обстоятельство, что первый доклад в Праге от Российской организационной комиссии по созыву конференции сделал Г. К. Орджоникидзе. Если до 1912 года «бакинцы» не были представлены в ЦК партии, то после Пражской конференции из 11 членов вновь избранного Центрального комитета РСДРП в его состав вошли 3 человека, представлявших Бакинский комитет большевиков или долго работавших в нем (Спандарян, Орджоникидзе, Сталин). Правда, Сталин, который не участвовал в работе конференции, не был избран ее делегатами, но его сразу после конференции заочно кооптировали в состав ЦК. В кандидаты в члены ЦК был кооптирован заочно и «бакинец» С.Г. Шаумян, арестованный в сентябре в Баку, а затем отправленный в ссылку.
Идя навстречу требованиям БК о переносе центра деятельности партии в Россию, конференция приняла решение о создании Русского бюро ЦК РСДРП в составе 10 человек. Трое из его членов были те же трое «бакинцев», которые стали членами ЦК РСДРП. Явно откликаясь на призывы БК, в состав ЦК и Русского бюро были введены партийцы с пролетарским происхождением и работавшие на производстве: М. И. Калинин, И. С. Белостоцкий, Г. И. Петровский, А. Е. Бадаев, А. С. Киселев, Р. В. Малиновский. Конференция приняла решение о создании ежедневной легальной партийной газеты в России, на чем настаивал Сталин еще с лета 1909 года. Избрание в руководство партии людей, в наибольшей степени выражавших интересы и чаяния рабочего класса России и к ослаблению позиций тех, кто, находясь в эмиграции, давно оторвался от родины и народа, положило начало повороту партии к признанию способности российского рабочего класса первому осуществить социалистическую революцию, а затем приступить к построению социализма.
Несмотря на то, что Сталин не был участником Пражской конференции, он впоследствии стал ее рассматривать как важнейшее событие в развитии партии. В своем выступлении в декабре 1927 г. на XV съезде партии Сталин говорил: «Эта конференция имела величайшее значение в истории нашей партии, ибо она положила межу между большевиками и меньшевиками и объединила большевистские организации во всей стране в единую большевистскую партию». В то время как после 1953 г. годом рождения большевистской партии стали считать 1903 г. – год II съезда РСДРП и возникновения большевистской фракции, в «Кратком курсе» утверждалось: «Пражская конференция положила начало партии нового типа, партии ленинизма, большевистской партии».