1 октября 1950 года в час ночи был оглашен приговор. В два часа ночи H. A. Вознесенский, A. A. Кузнецов, М. И. Родионов, П. С. Попков, Я. Ф. Капустин, П. Г. Лазутин были расстреляны. Прах их тайно захоронили на Левашовской пустоши под Ленинградом. И. М. Турко, Т. В. Закржевскую, Ф. Е. Михеева и других осудили на длительное тюремное заключение.
После казни «главных подрывников» в Москве по приговору суда были расстреляны 20 человек: М. А. Вознесенская, A. A. Вознесенский, П. Н. Кубаткин, Г. Ф. Бадаев — секретарь Ленинградского обкома ВКП(б); М. В. Басов — заместитель председателя Совета Министров РСФСР, председатель Госплана РСФСР; В. О. Белопольский — технический сотрудник Ленинградского горисполкома; П. Т. Бондаренко — заместитель командующего Черноморским флотом по политической части, контр-адмирал; A. A. Бубнов — секретарь исполкома Ленгорсовета; А. И. Бурилин — заместитель председателя
Леноблисполкома; А. Д. Вербицкий — заместитель министра Морского флота СССР, ранее — секретарь Ленин градского горкома ВКП(б); В. П. Галкин — заместитель председателя Ленгорсовета; В. Н. Иванов — второй секретарь ЦК ВЛКСМ; П. И. Левин — секретарь Ленинградского горкома ВКП(б); М. Н. Никитин — секретарь Ленинградского обкома ВКП(б); М. И. Петровский — секретарь Крымского обкома ВКП(б); М. И. Сафонов — председатель Новгородского облсовета, ранее — заместитель председателя Леноблсовета; П. Т. Талюш — секретарь Саратовского обкома ВКП(б), ранее — заведующий отделом Ленинградского обкома ВКП(б); И. С. Харитонов — председатель исполкома Леноблсовета; П. А. Чурсин — секретарь Крымского обкома ВКП(б).
Их тела были кремированы и захоронены на кладбище Донского монастыря; сегодня это «Могила № 3 невостребованных прахов». На ней в 1990-е годы сооружен мемориал «Памяти жертв политических репрессий 1945–1953 годов». На плитах с именами погибших по «ленинградскому делу» надпись: «Ленинградцы… Честь, Долг и Отчизна были для вас превыше всего. Время сохранит ваши имена…»
Всего по «ленинградскому делу» были осуждены 214 человек, в том числе 145 близких и дальних родственников основных обвиняемых.
Характерно, что следователям и судьям было дано указание, чтобы имя Жданова нигде не упоминалось. Очевидно, бывший второй человек партии, ее идеолог, не мог быть вдохновителем группы, раскалывающей Советское государство.
Впрочем, первоначально имя Жданова все же фигурировало в деле.
Вот как пишет об этом петербургский историк: «По мере того, как раскручивался маховик „ленинградского дела“, специально собирали компромат и на Жданова. Затем прекратили. Однако заметим, что во вставках Сталина в текст подготовленного проекта закрытого письма Политбюро членам и кандидатам в члены ЦК ВКП(б) „Об антипартийной враждебной группе Кузнецова, Попкова, Родионова, Капустина, Соловьева и др.“ трижды упоминается имя Жданова. Согласно вставкам, Кузнецов был переведен на работу в ЦК по рекомендации тов. Жданова, Кузнецов злоупотреблял доверием тов. Жданова, кадровые назначения происходили при поддержке тов. Жданова, питавшего полное доверие к Кузнецову. Причем Сталин дважды зачеркивал слово „полное“, менял его на „безграничное“ и в конце концов восстановил свой первоначальный вариант». (Кутузов В.А. A. A. Жданов или A. A. Кузнецов? К вопросу о лидерстве в блокированном Ленинграде. Новейшая история России. 2012. № 1. http://history.spbu.ru/ userfiles/Bogomazov/03_Kutuzov.pdf)
Не исключено, что в период разгрома ленинградцев была упущена единственная реальная возможность изменить национально-государственное устройство СССР и перейти к территориальному федерализму, отменив санкционированный Лениным в 1922 году и тогда оспоренный Сталиным союз национальных республик. Это отняло бы у республиканских национальных элит козыри, которыми сперва под флагом интернационализма, а потом «коренизации» они воспользовались для достижения своих узких целей и дезинтеграции страны.
Уже во времена Юрия Андропова, который отрицательно относился к деятельности так называемых «русистов» (неловкий эвфемизм КГБ), была попытка вернуться к роковой проблеме.
Бывший помощник Генерального секретаря ЦК КПСС Аркадий Вольский рассказывал: «У него была идефикс — ликвидировать построение СССР по национальному принципу. Межнациональная рознь в СССР подавлялась. Не была такой злобной, как ныне. Однако тлела всегда. Как-то генсек меня вызвал: „Давайте кончать с национальным делением страны. Представьте соображения об организации в Советском Союзе штатов на основе численности населения, производственной целесообразности, и чтобы образующая нация была погашена. Нарисуйте новую карту СССР“.