Уже летом 1941 года не могло оставаться сомнений в том, что военное производство Чехословакии значительно понижается. На основных оружейных заводах страны производство понизилось к сентябрю на одну треть, и есть все причины к тому, чтобы предполагать, что в сентябре это понижение было еще сильней. В некоторых рудниках Понижение достигло 65%. Кроме неблагоприятного развития промышленного производства немецкие власти были обеспокоены затруднениями, возникшими на транспорте. Порча железнодорожного состава сама по себе могла вызвать ряд несчастий из-за опозданий, которые происходили на перегруженных линиях. Но есть основание думать, что железнодорожные служащие делали все возможное, дабы усилить непригодность перегруженной железнодорожной сети.
27 сентября 1941 г. пражское радио сообщило следующее:
«Имперский министр барон фон Нейрат, имперский протектор в Богемии и Моравии, нашел нужным просить фюрера о длительном отпуске для восстановления здоровья. Так как настоящее военное положение требует полного внимания имперского протектора, барон фон Нейрат одновременно просил фюрера освободить его временно от должности имперского протектора до тех пор, пока не восстановится его здоровье, и назначить на это время заместителя.
Ввиду этих обстоятельств фюрер удовлетворил просьбу имперского протектора и поручил обергруппенфюреру Гейдриху исполнять должность имперского протектора в Богемии и Моравии на время болезни имперского министра фон Нейрата».
Рейнгард Гейдрих был в Праге уже 26 сентября 1941 г. в сопровождении 62 офицеров полиции и целого сыскного аппарата. 28 сентября за его подписью было издано постановление, касающееся объявления чрезвычайного положения.
Это постановление уполномочивало рейхспротектора объявить чрезвычайное положение во всем протекторате Богемии и Моравии или же в отдельных районах.
Самым важным следствием объявления чрезвычайного положения являлось то, что значительная часть юрисдикции в преступных делах передавалась особым судам.
Важное значение имело то, что во время чрезвычайного положения могли быть сделаны отклонения от действующего закона путем введения мероприятий «по сохранению и восстановлению общественной безопасности и порядка».
Право объявления чрезвычайного положения было применено не позже чем 28 сентября 1941 г. Декретом, подписанным Гейдрихом, чрезвычайное положение объявлялось для районов Праги и Брно, а через несколько дней — для оставшейся части протектората. Особые суды, которые были немедленно введены, действовали в течение всего периода и вынесли 778 смертных приговоров. Тысяча человек была передана гестапо...
27 мая 1942 г. чешские патриоты совершили покушение на Гейдриха. Гейдрих, с именем которого связана волна жестоких репрессий, начатых 27 сентября 1941 г. и направленных против Движения Сопротивления в Чехословакии, был смертельно ранен и умер от ран 4 июля 1942 г.
Декретом от 27 мая 1942 г., подписанным Франком за рейхспротектора, вступило в силу чрезвычайное положение (во второй раз) для всего протектората Богемии и Моравии. Снова выступили на сцену пользовавшиеся дурной славой особые суды...
Согласно свидетельству, находящемуся в распоряжении Чехословацкого правительства, более 1 450 смертных приговоров было вынесено особыми судами. Эти факты доступны в настоящий момент. Вероятно, число смертных приговоров и казней еще выше. О тех, кого особые суды послали в концлагеря, мы ничего не знаем.
Об особых судах, введенных 27 мая 1942 г., можно сказать то же самое, что и о тех, которые были учреждены 28 сентября 1941 г. Их также нельзя считать судами, и их процедура не является судебным следствием. Они лишь орудие террора...
Франк заявил, что особые суды были лишь простыми машинами для вынесения огромного количества смертных приговоров. Будучи допрошен чехословацким военным следователем, он констатировал: «В июле 1942 года Гиммлер передал мне по телефону личное распоряжение Гитлера. Он приказывал казнить 40 тыс. чехов, подозреваемых в политической деятельности, в качестве репрессии за убийство Гейдриха».