Комиссия регулярно публиковала подробные «Бюллетени» о появлении в разных частях мира заболеваний чумой, холерой, желтой лихорадкой с указанием цифр заболеваний и смертных случаев, а также публиковала списки местностей в России, «угрожаемых» и «неблагополучных» по этим болезням. Сообщения перепечатывались из газеты «Правительственный вестник» в официальный же орган «Вестник общественной гигиены», занимая в его ежемесячных выпусках по несколько страниц. К сообщениям о «движении чумы и холеры» стали присоединяться с 1905 г. сведения о заболеваниях в России сибирской язвой и эпидемическим цереброспинальным менингитом. Такая практика существовала вплоть до 1916 г. (Васильев К.Г., Сегал А.Е., 1960).
Располагая по тем временам огромными денежными средствами (в некоторые годы казначейством отпускалось до 2 млн. рублей, кроме сумм, непосредственно выданных городским и земским организациям на противоэпидемические нужды), Комиссия распоряжалась в сложной чиновничье-бюрократической машине царской администрации не только всей борьбой с чумой и холерой, но с 1908 г. на нее была возложена и борьба с сыпным тифом, с осени 1911 г. — борьба с заразными заболеваниями «в постигнутых недородом местностях империи», а с октября 1914 г. — мероприятия по борьбе с инфекциями в подвергшихся нападению неприятелей губерниях. Комиссия пыталась даже сосредоточить в 1915 г. в своем распоряжении все средства, отпускавшиеся во время мировой войны на противоэпидемические цели общественным организациям, возникшим в тот период (Всероссийский земский союз и Всероссийский союз городов).
Практические мероприятия Комиссии начались с отправки в феврале 1897 г. экспедиции для изучения чумы под началом известного патолога, бактериолога и эпидемиолога В.К. Высоковича в Бомбей. Экспедиция в составе трех человек (В.К Высокович, Д.К Заболотный, Е.А. Редров) действовала в Бомбее, в Grand Road Hospital и Churni Hospital.
Комиссия была снабжена необходимыми аппаратами и инструментами для бактериологического исследования и патологоанатомических вскрытий и выяснила в течение нескольких месяцев работы ряд важных в эпидемиологии и патогенезе чумы вопросов. На обратном пути Д.К. Заболотный посетил Аравию, в следующем году он же организовал по поручению Комочума экспедицию для обследования чумных эндемических очагов в Монголии, Китае и Забайкалье, в 1900 г. он поехал на вспышку чумы в г. Глазго (Шотландия).
В 1898 г. российским правительством в Индию «для наблюдения за ходом эпидемии чумы и своевременного донесения наиболее интересных данных» были посланы несколько известных русских исследователей: А.М. Левин, В.П. Кашкадамов, С.А. Марк и другие.