"Железняков" обстреливал немецкие части на Северной стороне до тех пор, пока на стволах орудий не начинала гореть краска. Немецкая авиация несколько раз обрушивала вход в тоннель. 26 июня 1942 года более 50 бомбардировщиков противника нанесли мощный удар по Троицкому тоннелю. Многотонная глыба обрушилась на 2-ю бронеплатформу. Часть экипажа удалось вытащить через десантные люки в полу вагона, затем рельсы лопнули, и приваленная глыбами бронеплощадка оказалась прижатой ко дну тоннеля. Второй выход из тоннеля оставался свободным, паровоз вывел уцелевшую бронеплощадку, которая вновь открыла огонь по противнику.
Погребенный под толщей скалы "Зеленый призрак" нанес свой последний удар. На следующий день немецкая авиация обрушила последний выход из тоннеля. Бронепоезд погиб, но его экипаж еще сражался, установив несколько минометов в районе ГРЭС.
30 июня остатки экипажа были блокированы в полузасыпанном тоннеле. Немцы, выслав парламентера, предложили покинуть тоннель скрывавшимся здесь от бомбежек мирным жителям. С ними отправили медсестер бронепоезда. "Железняковцы" держались в тоннеле до 3 июля. Только немногие уцелевшие попали в плен.
Оккупировавшим Севастополь немцам в августе 1942 года удалось расчистить Троицкий тоннель для движения своих поездов. В некоторых источниках пишется, что: "... восстановив часть бронеплощадок "Железнякова", немцы создали из них бронесостав "принц Ойген", вооружив его 105-миллиметровыми гаубицами с переоборудованными лафетами. В месте с бронепоездом "Михель" германского производства, вооруженным, 88-мм зенитными орудиями, "Ойген" участвовал в боевых действиях в районе Перекопа, а также на Ишуньских позициях. Когда советские войска прорвали немецкую оборону Севастополя на Сапун-горе бронесостав "Ойген" был взорван своим экипажем.". Более внимательное изучение материалов эти данные не подтверждают. Бронеплощадки "Железнякова" были извлечены из под завала, и оттянуты на запасные пути. Две бронеплощадки были раздавлены обрушившимся сводом, у них была выведена из строя ходовая часть. Действительно в Крыму действовал бронепоезд, имевший схожую конструкцию бронеплощадок, но вооружен он был орудиями 34К, к которым у немцев было достаточно боезапаса, но к "Железнякову" он отношения не имел, а был составлен из захваченных площадок б/п "Орджоникидзевец" и N1.
В 70-е годы возле Севастопольского железнодорожного вокзала был установлен паровоз типа "ОВ" - однотипный паровозу "Железнякова", на котором воспроизвели надпись "Смерть фашизму", украшавшую борта бронепоезда. К сожалению, на локомотив не стали наносить камуфляжную раскраску, давшее "Железнякову" имя "Зеленого призрака", выкрасив его черным лаком.
В начале 90-х годов рядом с паровозом разместили 180мм орудие на железнодорожной платформе послевоенной постройки, которое несведущие в истории туристы, принимают теперь за одну из бронеплощадок легендарного бронепоезда "Железняков". К сожалению оба эти объекта, составляющие памятник бронепоезду, к "Железнякову" отношения не имеют.