С начала 1890-х годов о. Иоанн все резче критиковал популярного и влиятельного в обществе писателя графа Льва Толстого. В России тех лет сложилось как бы два центра влияния на сознание народа: так сказать центробежный – Лев Толстой и центростремительный – Иоанн Кронштадский, призывавший отказаться от революционных заблуждений и объединиться вокруг царя и церкви, ради спасения России.
Писатель разработал религиозную систему пантеистического характера («Бога Творца нет; я – часть Бога»), и изложил ее в опубликованных им сочинениях. Толстой отвергал учение о божественности Христа, догматы о троичности Божества, об искуплении, о непорочном зачатии и воскресении из мертвых. Вслед за отвержением главных догматов писатель подвергает критике все учение Церкви: о сотворении мира, о мире духовном…Он стал резко критиковать, «хулить» Священное Писание и Православную Церковь. В результате чего 20–22 февраля 1901 года определением Святейшего Синода № 557 был отлучен от Церкви.
Отец Иоанн обличал Толстого в проповедях, им также было написано более 20 статей в защиту православного вероучения, среди них «Ответ пастыря церкви Льву Толстому на его «Обращение к духовенству», «О душепагубном еретичестве графа Л.Н. Толстого», «В обличение лжеучения графа Л. Толстого».
Отец Иоанн критиковал Толстого, в частности, за то, что последний «извратил весь смысл христианства», «задался целью… всех отвести от веры в Бога и от Церкви», «глумится над Священным Писанием», «хохотом сатанинским насмехается над Церковью», «погибает вместе с последователями». Считал, что учение Толстого усилило «развращение нравов» общества, что его писаниями «отравлено множество юношей и девиц», что толстовцы «испровергают Россию и готовят ей политическую гибель».
Предсказывал ему «лютую» смерть: «Смерть грешника люта. И смерть его – Толстого – будет страхом для всего мира. (Конечно, это скроют родные)», – писал Иоанн Кронштадтский в дневнике 1907–1908 годов. Как передает через келейницу и монахинь со слов сестры графа сподвижник о. Иоанна Я.В. Ильяшевич (псевдоним – И.К. Сурский) (см. Приложение, стр. 586), это предсказание исполнилось: в последние дни жизни Толстой будто бы страдал от видений ужасных чудовищ.
Отношение к Иоанну Кронштадскому в обществе было далеко не однозначным. Простой народ его боготворил, аристократия и либеральная интеллигенция презирала и ненавидела.
Характерна оценка личности Иоанна лейб-хирургом Н.А. Вельяминовым, проведшим вместе с ним в Ливадии последние дни жизни императора Александра III: «Думаю, что это был человек по-своему верующий, но прежде всего большой в жизни актер, удивительно умевший приводить толпу и отдельных более слабых характером лиц в религиозный экстаз и пользоваться для этого обстановкой и сложившимися условиями. Интересно, что отец Иоанн больше всего влиял на женщин и на малокультурную толпу; через женщин он обычно и действовал; влиять на людей он стремился в первый момент встречи с ними, главным образом, своим пронизывающим всего человека взглядом – кого этот взгляд смущал, тот вполне подпадал под его влияние, тех, кто выдерживал этот взгляд спокойно и сухо, отец Иоанн не любил и ими больше не интересовался. На толпу и на больных он действовал истеричностью тона в своих молитвах. Я видел отца Иоанна в Ливадии среди придворных и у смертного одра государя – это был человек, не производивший лично на меня почти никакого впечатления, но бесспорно сильно влиявший на слабые натуры и на тяжело больных. Потом, через несколько лет, я видел его на консультации больным в Кронштадте, и это был самый обычный, дряхлый старик, сильно желавший еще жить, избавиться от своей болезни, и нисколько не стремившийся произвести какое-либо впечатление на окружавших. Вот почему я позволил себе сказать, что он прежде всего был большой актер…».
После издания Высочайшего манифеста 17 октября 1905 года и последовавшей либерализации цензуры, в русской прессе стали печатать негативные статьи и карикатуры на Иоанна Кронштадтского, порой носившие непристойный и насмешливый характер, была развернута целая кампания по травле и дискредитации Иоанна Кронштадского[33]
.Впервые о. Иоанн серьезно заболел в декабре 1904 года; 3 января 1905 года над ним, по его просьбе, причтом Андреевского собора было совершено таинство елеосвящения, которое проходило при большом стечении народа вокруг дома о. Иоанна. Последние 3 года он страдал «мучительной болезнью». Некоторые почитатели связывают последнее с преданием об увечиях, нанесенных о. Иоанну в паховую область, в одном из домов, куда его пригласили якобы для молитвы над больным, страшно избили и хотели оскопить.
Случайно спасшийся отец Иоанн попросил своих спутников никому об этом не рассказывать, «чтобы не было погромов».
Однажды на проповеди о. Иоанн укорил кронштадтцев: «Такие корабли строите, а собор достойный Российского флота построить не можете!».