С октября 1941-го по сентябрь 1942 года школа приняла участие в формировании и подготовке летных экипажей пяти авиаполков, отправляющихся на фронт. Командирами полков были назначены подполковник В. Н. Кулаков-Павлов, майоры П. Д. Бондаренко, И. В. Селиверстов, капитаны М. Н. Афанасьев, К. В. Яровой. В состав авиаэскадрилий вошли летчики-инструкторы училища, а штурманами экипажей стали выпускники школы. За годы войны здесь было 25 выпусков штурманов, 18 выпусков стрелков-радистов, школа подготовила 7524 воздушных бойца. За большие заслуги в деле подготовки штурманских кадров для боевых частей авиации около 800 командиров, преподавателей и инструкторов были награждены орденами и медалями. В канун 1944 года училищу вручили боевой орден Красного Знамени.
28 выпускников училища стали Героями Советского Союза. Сотни воспитанников стали заслуженными военными штурманами СССР, штурманами-снайперами. Тысячи штурманов несли и несут ратную службу почти во всех авиационных гарнизонах России.
Старейшее военное училище, а ныне военный институт, продолжает готовить специалистов высшего класса для военной авиации России.
Военные автомобилисты.
Великая Отечественная война показала, какую огромную роль играла артиллерия в исходе сражений, в достижении победы над врагом.
Вновь создаваемые артиллерийские части и соединения к 1944 году были полностью переведены на механическую тягу, что в значительной степени повысило их маневренность и маршевые возможности.
В связи с интенсивным техническим оснащением артиллерийских войск возросла потребность и в специалистах, способных эксплуатировать сложную автомобильную и гусеничную технику. Для подготовки таких специалистов для артиллерии стали создаваться курсы автотракторных техников. В январе 1944 года начальником Главного артиллерийского управления Красной Армии был подписан приказ о формировании курсов автотракторных техников № 40 в Куйбышеве.
Первыми курсантами стали фронтовики — солдаты и сержанты, имевшие права водителя или тракториста. Среди них прошли курс обучения Герой Советского Союза Я. Ф. Шапошников; участники обороны Ленинграда и прорыва блокады Б. И. Олехов, В. И. Резвов, И. П. Тоболов, И. А. Шарий; защитники Сталинграда И. М. Баков, И. И. Фука и другие.
Однако объем знаний, который курсанты получали на курсах, не в полной мере отвечал требованиям, предъявляемым к офицерам автотракторной специальности. Поэтому 30 мая 1944 года курсы были преобразованы в училище автотракторных техников артиллерии. Местом постоянной дислокации училища стал Челябинск.
После завершения реорганизации 16 июня 1944 года начальником училища был подписан приказ № 1. Этот день и стал днем рождения Челябинского военного автомобильного училища.
Училище первоначально состояло из двух батарей, которыми командовали майор В. П. Сичкарь и капитан А. 3. Михайлов. Два потока курсантов должно было выпустить училище в ноябре и декабре 1944 года. За полгода надо было подготовить из них офицеров, начальников ремонтных мастерских полков. Главное внимание уделялось специальной и военной подготовке с артиллерийским уклоном.
Ветераны вспоминали 4 августа, когда выпускники курсов сдавали экзамены прямо на станции. Обстановка была необычной: на погрузочной площадке были расставлены столы, разложены детали и узлы машин, развешены схемы. Курсанты сдавали экзамены уверенно, подтверждая хорошие знания. Отсюда же, с воинской станционной площадки, провожали на фронт выпускников курсов № 40.
7 августа эшелон, в котором разместилось училище, направился на Урал. Четыре дня пути — и он прибыл в Челябинск.
Военный городок, где устроилось училище, известен челябинцам под названием Красные казармы.
В ноябре — декабре 1944 года состоялись очередные выпуски специалистов с присвоением звания «техник-лейтенант». Молодые офицеры были направлены в действующую армию и приняли участие в освобождении Венгрии, Чехословакии, в битве за Берлин, в разгроме Японии.
В канун нового, 1945 года прибыло очередное пополнение из числа призывников, еще не служивших в армии.
Со временем училище имело почти все образцы отечественной автотракторной техники, подвижные ремонтные мастерские. В учебных целях использовались автомобили «ГАЗ-ММ», «ЗИС-5», тракторы «С-65», а также некоторые образцы американских машин.
Закончилась зима 1944/45 года — время становления училища. Офицеры и курсанты не жалели сил и труда, чтобы быть достойными тех, кто в это время с оружием в руках приближал победу над гитлеровской Германией.
В тот год весна в Челябинске наступила раньше обычного, украсив город молодой зеленью. В ту весну на нашу землю пришел великий праздник — День Победы. Он вошел в каждый дом, в каждую семью.
С окончанием войны изменилась система подготовки специалистов в военном автоучилище.