Монастырь официально закрыли в 1918 г., он полностью прекратил существование в 1925 г., его имущество и земли конфисковали. Правда, какое-то время монастырь существовал фактически нелегально в качестве «сельскохозяйственного общежития», «Воскресенского трудового братства» и колхоза «Труд». Затем начались аресты, арестовали игуменью в 1927 г., шесть монахинь в 1931 г., всех остальных сестер в 1932 г. В разграбленном монастыре остались только больные, престарелые, немощные, их закрыли в подвале и обрекли на смерть. Арестованных монахинь отправили в лагеря и ссылки в 1935 г. Монастырские храмы были разграблены, уничтожили монастырские церкви: старую Казанскую, Скорбященскую, Ильинскую и Исидоровскую с колокольней, осквернили кладбище.
В 1990-е годы в закрытом монастыре стала постепенно возрождаться религиозная жизнь. В 1990 г. возник приход, в 1992 г. верующим вернули храм во имя Казанской иконы Божией Матери, в 1997 г. монастырь возродился, в 2001 г. обители был возвращен почти весь монастырский комплекс. Началось восстановление всех исторических строений монастыря и возрождение храмов. В монастыре открыты богадельня, швейная и реставрационные мастерские. При монастыре работает школа дополнительного образования (размещенная в бывшей Свято-Владимирской церковно-учительской школе), в ней изучают Закон Божий, церковное пение, рукоделие и др. При монастыре открыта богадельня. В обители живут более 30 насельниц. В окрестностях Петербурга в Тосненском районе в поселке Лисино-Корпус есть монастырское подворье. Монастырь помогает в восстановлении храмов в окрестностях Петербурга.
Монастырь имеет многочисленные святыни: фамильный крест Дома Романовых с частицей Древа Креста Господня; чтимый образ великомученика Пантелеймона с частицей мощей (благословение Святой Горы Афон); иконы великомучеников Георгия Победоносца, Пантелеймона, святителя Тихона (патриарх Московский), святителя Игнатия Брянчанинова (Кавказского), княгини Анны Кашинской с частицами мощей; древняя икона Страшного суда (дар В.В. Путина); икона Казанской Божией Матери (обновилась в 1996 г., пребывает в Казанском храме); икона Спасителя, ковчег с частицей мощей священномученика архиепископа Верейского Илариона (Троицкого) и его погребальное облачение.
Особым почитанием в монастыре пользуются иконы Казанской Божией Матери и Спасителя. Казанскую икону, пребывавшую в Никольском соборе Петербурга, собирались реставрировать, но она чудесным образом обновилась в 1996 г., когда приняли решение о ее передаче в Казанский храм этого монастыря. Прояснились не только краски (потемневший образ стал совершенно ясным), но и посветлела и обновилась даже старая почерневшая доска. В 2004 г. монастырю подарили икону Спасителя, написанную в 1886 г. Вернули эту икону в Россию и подарили ее монастырю внуки великого князя Петра Николаевича Романова – Николай Петрович и Дмитрий Романович Романовы. Эта икона в 1908 г., перед погребением святого праведного Иоанна Кронштадтского, всю ночь покоилась на его честных останках.
В 2003 г. в монастыре были обретены честные останки игумении Антонии (Рейнбот), которая сделала очень много для развития, благоустройства этого монастыря. Именно при ней по проекту В.А. Косякова в 1908 г. заложили каменный храм-усыпальницу во имя Казанской иконы Божией Матери.
Прибывающие в монастырь восхищаются собором Воскресения Христова (1848–1861), рядом видят церковь во имя Казанской иконы Божией Матери (1908–1912). Верующие вспоминают причисленных к лику святых архиепископа Илариона и митрополита Серафима.
В монастыре в 1920-е годы жил митрополит Серафим (Чичагов), перебравшийся в строения Новодевичьего монастыря после закрытия Александро-Невской лавры. Он проводил в 1929 г. здесь в последний путь архиепископа Илариона (Троицкого), останки которого потом почти 70 лет покоились на местном Новодевичьем кладбище. В 1998 г. мощи мученика Илариона были обретены и в 1999 г. перенесены в Москву.