С 1 июля 2003 года указом Президента Российской Федерации В. Путина № 306 от 11 марта 2003 года Федеральная служба налоговой полиции упразднена без объяснения причин. Большинство функций ФСНП России и штат в 16 тысяч единиц переданы Министерству внутренних дел. Материальная база и 40 тысяч штатных единиц переданы во вновь созданный Государственный комитет Российской Федерации по контролю за оборотом наркотических средств и психотропных веществ (Госнаркоконтроль), который возглавил бывший знакомый Кармацкого по работе в Ленинградском Управлении КГБ генерал В. Черкесов. "Кто помог Кармацкому пересесть в кресло руководителя питерской наркополиции и при этом получить по две большие звезды на погоны — загадка", — читаем мы в "Российской газете". Догадайся, мол, сама. "Я спросил своего собеседника из спецслужб, как такой "специалист" смог продолжить служебную карьеру, — продолжает корреспондент "РГ". — Тот помолчал, а потом показал пальцем куда-то в потолок. Затем сказал: "Надо будет, объявим в международный розыск. Уверяю вас, мы его найдем. И подробно расскажем общественности о его "серой" деятельности. Не помогут ему высокие связи, не то время. Хотя, не исключено, что его постараются ликвидировать. Слишком много ему известно о коррупции больших чиновников и их связях с криминалитетом".
Намек "собеседника из спецслужб" был достаточно прозрачен, чтобы догадаться: Кармацкому либо открыли границу так же, как некогда Абрамовичу из той байки про советского пограничника, и он теперь для российского правосудия недостижим, либо где-то его тихо закопали, так что никто и никогда его тайн уже не узнает. А Кармацкий мог рассказать, судя по всему, немало.
"Генералами не рождаются, а вот полковником товарищ Кармацкий стал в "лихие девяностые" годы в знаменитом теперь питерском Управлении госбезопасности, где он трудился в Службе экономической контрразведки, — писал, комментируя его объявление в розыск, журналист портала "Вслух". — О странных взаимоотношениях Кармацкого с криминальными авторитетами культурной столицы, личных слабостях полковника давно и немало знали как его коллеги из местных правоохранительных структур, так и в бизнес-среде. Оптимизм и отвага, с которыми Александр Иванович осваивал новые, все более солидные должности, не печалясь по поводу своих репутационных проблем, лишь добавляли к нему уважения в известных кругах. Но кто-то, наверное, и тогда задумывался, как это ему, постоянно спотыкаясь, удается держаться на важнейших позициях в Управлениях ФСБ, Налоговой полиции, Наркоконтроля? В чем же его секрет? Конечно, не только в том счастливом совпадении, что в свое время среди подчиненных Кармацкого были нынешние столпы Лубянки: Сергей Смирнов (первый замдиректора ФСБ России), Алексей Седов (руководитель Службы по борьбе с терроризмом ФСБ), Виктор Воронин (начальник Управления "К" ФСБ), Сергей Чернышев (начальник Управления "Т" ФСБ), Владимир Крючков (начальник Управления "М" ФСБ), а также директор ФСКН Виктор Иванов, его заместитель Олег Сафонов и довольно много других серьезных людей.
(В 2001 г. "Ленинградская правда" привела такой список сослуживцев Кармацкого: "Свою работу в органах КГБ СССР он начал в 70-х годах вместе с такими известными ныне фигурами, как Черкесов В. В., Полтавченко Г. С., Путин В. В., Седов А. С., Патрушев Н. П. и др.". Тогда никакой реакции на публикацию не последовало.) Самая большая удача Кармацкого все-таки не в этом замечательном списке друзей, а в том, что довелось ему когда-то послужить заместителем у самого известного начальника Службы экономической контрразведки питерского УФСБ Николая Патрушева. Кармацкий сумел завоевать его доверие до такой степени, что Патрушев оставил ему свое место, убедив принять такое решение тогдашнего начальника питерской госбезопасности Сергея Степашина.