В начале 1941 года первым Генеральным директором МИ-5 был назначен сэр Дэвид Петри, которому правительство предоставило все необходимые материальные и людские ресурсы для того, чтобы создать солидную и эффективную организацию, способную решать задачи по обеспечению безопасности Империи. Англичанам было хорошо известно, что германская разведка на территории Великобритании имела свою агентуру даже в парламентских кругах государства. При этом германская разведка постоянно «стимулировала» ее работу, заставляя добывать «более значимую информацию». Делалось это, в частности методом запугивания разоблачением шпионской деятельности конкретных агентов. В целях введения в заблуждение англичан немцы практиковали засылку наряду с действительными квалифицированными шпионами и так называемых «подставных», намеренно выводя их в поле зрения британской контрразведки. Это приводило к тому, что такие «подставы» брались английской контрразведкой под контроль, после чего МИ-5 начинала считать, что держит в своих руках основные нити германской агентурной сети. Предполагалось, что отвлечение сил контрразведки противника на негодные объекты будет сковывать силы МИ-5, а в это время ценные источники немцев получат возможность действовать почти беспрепятственно. Этот метод до настоящего времени успешно используется разведками всего мира, что неизменно ставит в весьма затруднительное положение контрразведку.
Вполне естественно, что британские спецслужбы стремились держать «под колпаком» деятельность резидентур германских спецслужб за счет собственной вербовочной работы. Немало агентов в этот период завербовала и британская контрразведка, в том числе и на территории противника. Известен случай, когда МИ-5 получила сигнал о том, что один английский чиновник всеми средствами добивается перехода на службу в английское посольство в Швейцарии. Установленное за ним наблюдение позволило английской контрразведке выяснить, что он живет не по средствам. Более пристальное изучение показало, что он связан с германской разведкой. После того, как по предложению английской контрразведки ему дали место, которого он добивался, было установлено, что все документы (предварительно сфальсифицированные англичанами), проходившие через его руки, стали регулярно попадать в руки немецкой разведки. После разоблачения он был перевербован МИ-5 и направлен в Германию с заданием работать на англичан.
А тем временем германские спецслужбы (в основном Абвер) энергично занимались вербовкой агентуры на территории Великобритании и заброской парашютно-десантных групп.
Нужно сказать, что в этот период в процессе противоборства МИ-5 с германской разведкой и англичане довольно успешно использовали метод подставы противнику агентов-двойников. Управлял сетью подстав специально созданный в этой связи Комитет двойного креста (Комитет XX, или «Дабл Кросс»), известный профессионалам под названием «Двадцатка». Действующему четко и эффективно Комитету удалось установить тайный контроль над большинством агентурных сетей германской разведки на территории Великобритании. Общение с плененными диверсантами происходило в обстановке строжайшей тайны. Их ставили перед простым выбором: работай на нас или умри. Восемнадцать человек из общего числа захваченных шпионов (16 в Великобритании и 2 испанца в Гибралтаре) были казнены. 15 человек повешены. 43-летний Йозеф Якобс (псевдоним «Джордж Раймер») во время неудачного приземления с парашютом сломал ногу и не смог самостоятельно взойти на эшафот. Его привязали к стулу во дворе лондонского Тауэра и расстреляли. Одного шпиона сначала оправдали, но потом вновь арестовали, и до конца войны посадили за решетку по обвинению в нарушении Закона о государственной тайне. Насколько известно, лишь одному шпиону удалось добраться до Соединенного Королевства в годы Второй мировой войны и избежать ареста (Я. В. Тер-Браак).
В ходе этой операции МИ-5 подставила немцам группу собственных агентов в качестве источников информации, работающих на Германию. Немцев удалось ввести в заблуждение. Они полагали, что в стане врага у них успешно работает надежная агентура, которая на самом деле действовала под полным контролем МИ-5, не вызывая у немцев какого-либо подозрения. В результате деятельности «Двадцатки» (Комитет XX) англичанам удалось перевербовать агента Абвера югослава Душко Попова, который перешел на сторону англичан вместе с находившимися у него на связи тремя агентами. Все они до конца войны успешно работали на МИ-5, дезинформируя Абвер.
Таким образом воссозданной во время Второй мировой войны МИ-5 удалось фактически лишить немцев всех агентурных источников, что подтвердилось после того, как в 1945 году были вскрыты и изучены архивы немецких спецслужб.