В 1948 г. Латеранские соглашения были подтверждены в ст. 7 итальянской конституции. Часть этих соглашений, а именно Конкордат, была пересмотрена в 1984 г. Новый Конкордат определяет источники финансирования церковного государства, порядок заключения и аннулирования браков. Назначение епископов в итальянские епархии больше не требует утверждения итальянского правительства. Религиозное обучение в обычных школах переведено в разряд факультативных дисциплин.
Государственный строй карликового государства можно считать абсолютной монархией, которой управляет Святой престол. Сувереном Святого престола является папа римский. Его избирает конклав кардиналов большинством голосов. Пост главы католической церкви считается практически пожизненным, хотя в исключительных случаях, например, при недееспособности понтифика, предусмотрено отрешение его от должности.
Подобная дилемма, в частности, стояла перед руководством католической церкви в последние месяцы жизни Иоанна Павла II. В руках папы сосредоточена вся законодательная, исполнительная и судебная власть. На практике понтифик делегирует руководство исполнительной властью государственному секретарю.
У Ватикана, как и у всякого уважающего себя государства, есть свои вооруженные силы. Латеранским пактом 1929 г. понтификам было разрешено иметь четыре вида вооруженных сил: почетная гвардия понтифика, палатинская (дворцовая) гвардия, папская жандармерия и швейцарская гвардия. Старейшим из этих формирований была швейцарская гвардия, основанная 22 января 1506 г. как личная охрана папы Юлия II. Набирают в эту гвардию по специальному соглашению между Святым престолом и Швейцарской конфедерацией только холостых католиков в возрасте 19–30 лет, имеющих швейцарское гражданство. Рекруты не могут быть ниже 175 см. Дослужившись за несколько лет до звания капрала, гвардеец получает право на женитьбу. Численный состав швейцарской гвардии невелик: так, в конце 2005 г., согласно Папскому ежегоднику (Annuario Pontificio), в подразделении насчитывалось 134 гвардейца. Тренировочные сборы гвардейцы проводят вместе со швейцарской армией. В обязанности швейцарской гвардии входит охрана Апостольского дворца и персоны самого понтифика.
Три других соединения папа Павел VI упразднил в 1970 г., но в 2002 г. папская жандармерия была восстановлена. Ей, в частности, доверена охрана государственных границ. В вопросах борьбы с преступностью жандармерия тесно взаимодействует с итальянской полицией, где имеется специальный ватиканский отдел. В случае необходимости папская жандармерия имеет право обратиться за помощью к гражданской Ассоциации святых Петра и Павла, наследницы дворцовой гвардии. Жандармерия занимается в основном полицейскими функциями, а также защитой понтифика во время его пребывания за пределами Ватикана.
Четыре десятилетия (1929–1969 гг.) в церковном государстве существовала смертная казнь. Она была предусмотрена за попытку покушения на папу. Законодательно смертная казнь отменена по инициативе папы Иоанна Павла II в 2001 г.
На конец 2008 г. Святой престол поддерживал двусторонние дипломатические отношения со 177 государствами, разумеется, не только с теми, где католического вероисповедания придерживается значительная часть населения. Например, в 2007 г. установлены дипломатические отношения с Саудовской Аравией. Кстати, Святой престол остается единственным государством в Европе, формально признающим Китайскую Республику (Тайвань).
Церковное государство не чуждо технического прогресса: с его территории с 1931 г. вещает католическое Радио Ватикана. Его основал сам Гульельмо Маркони. Радио работает в диапазонах средних и коротких волн, а также на частотах FM. Есть в городе-государстве вертолетная площадка, конечная станция 852-метровой железной дороги, соединенной с итальянской железнодорожной сетью, собственная телефонная сеть, резервная электростанция, телевизионный центр (с 1983 г.), который осуществляет подготовку и передачу в прямом эфире церковных служб, а также регистрацию всех важных событий в жизни Святого престола. Видеотека центра содержит более 4000 часов видеозаписей времен долгого понтификата Иоанна Павла II. В 1959 г. была основана Ватиканская фильмотека, в которой хранятся копии кинофильмов и телепередач, освещающих личность понтификов, а также их апостольскую и благотворительную деятельность, крупнейшие события в религиозной жизни человечества, а также игровые фильмы высокого художественного уровня.