Вожди ордена проявляли заботу о нуждах больных братьев. Их не только освобождали от каждодневных послушаний, постов и церковных служб, но и от наложенных на них наказаний. Братья, заболевшие проказой, получали пропитание и одежду. Для предупреждения болезней во всех орденах были приняты соответствующие меры. Это было тем более необходимо в климатических условиях Востока для ордена, члены которого находились под постоянной угрозой войны. Хотя труды братьев в госпитале принесли им бесценный опыт ухода за бедными и больными, каковым вряд ли обладали другие монашеские ордена. Каждую субботу больные братья могли открывать себе кровь, если только у них было разрешение на это со стороны настоятеля. Для лечения тяжелобольных еще прежде 1206 г. на Востоке существовал лазарет. Подобное медицинское учреждение имели наиболее важные коменды. Кварталы для больных, если была такая возможность, устраивались отдельно от остальных монастырских строений.
Когда брат заболевал, он удалялся в свою келью или ложился в постель в дортуаре, и он получал все необходимое для лечения. Если он не выздоравливал на третий день, то его переводили в лазарет. В случае болезни только магистр мог оставаться в своей комнате больше трех дней. Первоначально брат должен был просить разрешения для перевода в квартал для больных, и имеются свидетельства, что иногда такую просьбу удовлетворяли с неохотой. Позднее такого разрешения уже не требовалось, а лазарет также выделял места для собратьев и эсквайров.
Брат брал с собой койку и оружие и исповедовал свои грехи конвентуальному приору или каплану ордена, который обычно задавал ему следующие вопросы: является ли он должником, или, наоборот, кто-либо ему должен, или не имеет ли он во временном владении собственность, которая не принадлежит ему. Также обычно требовалось предоставить опись собственных вещей. Затем больному преподавали Святые Дары. Если это был служащий брат, то он отдавал ключи от кладовой приору. Во время пребывания в лазарете он получал все необходимое для питания и лечения по мере возможностей учреждения. По желанию после службы часов он мог присутствовать на мессе в церкви, и в лазарете также проходили обычные крестные ходы. Однако больной должен был просить разрешения на посещение общественной бани или места рекреации. Ему было запрещено играть в шахматы, читать куртуазную литературу и питаться запрещенными продуктами.
При лазарете была отдельная трапезная. Обеденный распорядок был тем же самым, что и в монастыре; но больные обслуживались прежде остальных братьев; им предлагались на выбор два разных блюда или одно, приготовленное двумя способами; и им подавали лучшее вино. Видно, что пища в лазарете была лучшего качества, чем в монастыре, и порции были больше. В лазарете также кормили братьев, которым на неделе отворяли кровь, в случае если они не получали добавочного питания за монастырским столом, и бейлифов и других старших братьев, которые после 1288 г. могли питаться там без получения разрешения.
Правосудие
Отправление правосудия было важнейшим фактором сохранения единства международного ордена; всех судили согласно законам, которые принимались в центре. Недоработки в Уставе были сами по себе важной причиной для дальнейшей активизации законодательной деятельности госпитальеров в XII–XIII вв. Однако на нее влияли побочные факторы: местные условия тех территорий, на которых находились центральные органы управления ордена, трагическая история крестовых походов, политические события в Европе и произошедшие изменения в ее экономике. Да и перед орденом госпитальеров были поставлены новые цели, и начался отход от первоначальных идеалистических планов, и, наконец, была осознана важная роль закона в напряженной атмосфере Реформации Высокого Средневековья.