Всю работу, связанную с формированием этого института на новом месте, оборудованием мало приспособленного для него помещения, подбором преподавательских кадров, разработкой новых учебных программ, взяли на себя старейшие деятели военно-спортивной работы, известные в прошлом спортсмены и активисты ЦДКА – заслуженный мастер спорта СССР генерал-лейтенант А. А. Тарасов, более десяти лет возглавлявший до того Инспекцию физической подготовки и спорта РККА, и полковник А. Б. Нечаев. Они предвидели широкие перспективы развития спортивной жизни в Советской Армии и связанную с ней растущую потребность в квалифицированных кадрах. При институте начала работу двухгодичная Высшая школа тренеров (ВШТ), комплектовавшаяся в основном армейскими и флотскими спортсменами. В конце сороковых годов ВШТ приняла первый поток слушателей, что дало спортсменам возможность получить специальное военно-спортивное образование. Многие сотни бывших известных армейских спортсменов получили образование в стенах Военного института и созданной при нем ВШТ. В настоящее время большинство тренеров ЦСКА – питомцы Ленинградского военного Института или военного факультета физической культуры и спорта.
Укрепился и расширился в те годы спортивный отдел ЦДСА. Во время Великой Отечественной войны, примерно с конца 1943 года, в ЦДСА начала возобновляться спортивная жизнь. Начальником отдела спорта ЦДСА в то время был назначен заслуженный мастер спорта СССР Д. М. Васильев. Б. А. Верниковский ушел с этого поста еще в 1938 году. После него спортивным отделом ЦДСА руководили Евгений Сергеевич Сретенский, Михаил Борисович Шмидт, а затем Дмитрий Прокофьевич Горин. Все они были большими знатоками спорта и хорошими военными специалистами.
М. Б. Шмидт – воспитанник дивизии Г. И. Котовского, унаследовал от своего командира любовь к спорту, долгие годы был заместителем командира дивизии по строевой части. В Великую Отечественную войну М. Б. Шмидт, героически сражаясь, погиб в боях под Кенигсбергом.
Полковник Д. П. Горин был крупным специалистом военно-физической подготовки и одним из сильнейших (в двадцатые годы) в стране борцов, не раз с успехом выступал за армейскую команду на всесоюзных соревнованиях по классической борьбе. В годы Великой Отечественной войны погиб при выполнении служебного задания.
Д. М. Васильев проработал в ЦДСА до 1948 года, пока не был переведен в Управление физической подготовки и спорта на должность главного тренера Советской Армии по лыжному спорту. Начальником спортивного отдела ЦДСА стал заслуженный мастер спорта СССР Виктор Александрович Андреев; через два года его сменил известный в прошлом футболист полковник Павел Васильевич Халкиопов, на смену которому пришел ветеран армейского спорта Михаил Михайлович Сомов.
Под руководством Д. М. Васильева в короткий срок оживилась спортивная работа, были восстановлены спортивные сооружения, вернулись в спортивные команды многие известные армейские тренеры и спортсмены.
В первые послевоенные годы особенно больших успехов добились игровые команды ЦДСА.
Под руководством старшего тренера, заслуженного мастера спорта СССР Бориса Андреевича Аркадьева был достигнут долгожданный перелом в футболе. В розыгрыше Кубка СССР в 1944 году футболисты ЦДСА дошли до финала, а в 1945 году выиграли его. Однако в первенстве страны они заняли тогда только второе место. Осенью 1946 года футболистам ЦДСА впервые в истории отечественного спорта были вручены золотые медали чемпиона СССР. И это повторялось в 1947, 1948, 1950 и 1951 годах. В этих чемпионатах особенно успешно выступали: В. Никаноров, И. Кочетков, К. Лясковский, А. Прохоров, Г. Федотов, А. Гринин, В. Демин, В. Николаев, В. Бобров, В. Соловьев, В. Чистохвалов, А. Водягин и другие.
Вместе с футбольной командой больших успехов на всесоюзной спортивной арене добилась тогда созданная в 1946 году команда ЦДСА по хоккею с шайбой. Лишь в зимнем сезоне 1947 года был проведен первый чемпионат СССР, а уже на втором чемпионате по хоккею с шайбой (в 1948 году) команда ЦДСА выиграла звание чемпиона страны. Первые для армейцев медали чемпиона СССР тогда завоевали В. Никаноров, Г. Мкртычан, В. Веневцев, В. Бобров, А. Тарасов, М. Орехов и Е. Бабич, Б. Афанасьев, В. Меньшиков, А. Старовойтов и В. Давыдов. В 1949 и 1950 годах хоккеисты ЦДСА повторили свой успех, причем команда выступала уже под руководством тренера и ведущего игрока, заслуженного мастера спорта капитана Анатолия Владимировича Тарасова.