В ходе реформы система управления Вооруженных Сил перешла с четырехзвенной (военный округ — армия — дивизия — полк) на трехзвенную (военный округ — армия — бригада). Были ликвидированы дивизионное и полковое звенья. Вместе с тем после реформирования сохранилась система военных округов. Именно на базе военных округов были созданы оперативно-стратегические командования. Таким образом, округам придан статус оперативно-стратегических командований (ОСК) по руководству всеми структурами Вооруженных Сил, находящихся на их территории. Кроме того, после реформирования сохранились все три вида и три рода войск: СВ; ВМС; ВВС, ПВО; РВСН; ВДВ и Космические войска. В Сухопутных войсках, как предполагалось, все воинские соединения и части должны были находиться в постоянной боевой готовности (ПБГ) и укомплектованными по штатам военного времени, как на контрактной, так и смешанной основе. Полностью контрактными собирались сделать все воинские соединения и части, дислоцирующиеся на Юге России. «Сегодня, — как пояснил начальник Генштаба, — лишь небольшая группа соединений и частей относится к категории ПБГ. Большая же их часть в составе нынешних ВС — это соединения и части сокращенного состава, а также кадрированные. В ходе реформы вторую группу частей заменяли частями ПБГ. «Создаваемые мотострелковые и танковые бригады будут общевойсковыми, чтобы они могли действовать на любом, в том числе изолированном, операционном направлении», — пообещал начальник Генерального штаба. Каждая такая бригада будет иметь соответствующие подразделения усиления. Бригада станет автономной, способной решать все задачи. Ей придадут модульный характер. Она будет оснащаться исходя из условий театров военных действий, на которых находится. Российские военные базы за рубежом также перейдут на бригадную структуру, а недавно созданные горные бригады останутся в своем нынешнем виде.
В соответствии с утвержденной концепцией развития ВВС в их составе, как и в СВ, будут находиться только соединения и воинские части ПБГ, которые соответственно будут укрупнены. Части армейской авиации, увы, остались в составе ВВС. В ходе реформы они должны быть укомплектованы новыми вертолетами (Ми-28Н, Ка-52), и только затем может встать вопрос об их передаче в Сухопутные войска. Командование специального назначения (КСпН) было расформировано и влилось во вновь созданное командование Воздушно-космической обороны (ВКО). В ВДВ сохранили дивизионную структуру, а в военных округах создали десантно-штурмовые бригады. После завершения реформы численность Вооруженных Сил России должна была составить 1 млн. человек. Из них 15 проц. — офицеры. Под эту численность был реорганизован и управленческий аппарат, в том числе Минобороны и Генштаб.
Вопросов «реформа Сердюкова» вызвала немало. Основным сокращениям подверглись Сухопутные силы. К 2012 году из 1890 частей и соединений осталось менее одной десятой — 172, т. е. проведено их сокращение почти в 12 раз. На базе дивизий Сухопутных войск запланировали к 2012 г. создать более 40 мотострелковых бригад постоянной готовности. Речь идет о небольших по численности — порядка 3–4 тысяч солдат и офицеров — высокомобильных и хорошо оснащенных ударных группировках, комплектовать которые будут «в основном контрактниками». «В основном» — значит, в частях ПБГ будут служить и призывники. Со всеми отсюда вытекающими…
Приходится констатировать некомпетентность в военных вопросах, царящую в высших эшелонах военно-политического руководства страны. Ошибочно полагать, что топ-менеджер универсален для всех отраслей. Нужно знать процесс, которым ты управляешь. Умение считать деньги и строить личные отношения не помогут человеку грамотно поставить задачу, если он не знает дело. Поэтому сегодня как никогда актуален лозунг защиты армии от дилетантов и их реформ».
Реформа шла довольно быстрыми темпами. Одной из первых, как объявили в октябре 2008 г., была разделена на более мобильные подразделения 106-я Тульская воздушно-десантная дивизия. Уже в начале 2009 года началось расформирование легендарной 2-й Таманской мотострелковой дивизии. Затем разделение на бригады накрыло не менее легендарную 4-ю Кантемировскую танковую дивизию и 98-ю Свирскую (Ивановскую) дивизию ВДВ. Для своих экспериментов министр обороны выбирал дивизии знаковые, наиболее продвинутые и лучше всех вооруженные. Видимо, неспроста.