Письмо это было послано на берег с британским офицером, который служил раньше в русском флоте и говорил по-датски.
Во втором своем письме Нельсон написал:
Как видим, Дании предстояло решить, должен ли ее страх перед могущественными союзниками и горячее сочувствие требованиям нейтральных сторон заставить ее претерпевать дальнейшие наказания, или же перенесенные уже страдания и все еще угрожающая опасность служат достаточным извинением для отхода ее от Лиги нейтральных стран. И решение было принято: первоначальное 24-часовое перемирие было подписано в восемь часов вечера на борту британского флагмана «Лондон». С датской стороны его подписал генерал Ханс Линдхольм.
3 апреля в Копенгагене Нельсон провел двухчасовые переговоры с Фредериком. Вице-адмирал потребовал от датчан либо разоружения флота, либо передачи его британской короне. После дальнейших длительных переговоров 8 апреля было подписано перемирие на 14 недель, а датский флот был частично затоплен, частично отправлен в Англию.
После этого боевые действия получили название «война канонерок» (от датской тактики использования небольших канонерских лодок против Британского королевского флота). Датско-норвежский флот был уничтожен, и датское правительство решило строить канонерки в больших количествах, чтобы компенсировать потери. Датский командующий (а позже адмирал) Стеен Андерсен Билле был активным сторонником стратегии использования канонерок. Проекты канонерок были первоначально разработаны шведом Фредриком Хенриком Чапменом. Стратегическое преимущество канонерок заключалось в том, что они могли строиться быстро и без лишних затрат во всем королевстве. Тактическим преимуществом канонерок было то, что они были очень маневренны, особенно в неглубоких водах, и в них было тяжело попасть при обстреле. С другой стороны, лодки были уязвимы и нередко тонули от единственного попадания. Их также нельзя было использовать в бурном море и против больших кораблей. Тем не менее, датско-норвежское правительство построило более 200 канонерок двух моделей: шлюп-канонерка (экипаж из 76 человек, 18- или 24-фунтовая пушка в носовой части, а другая — на корме) и малая канонерка (экипаж из 24 человек, одна 24-фунтовая пушка на носу).
В течение первых трех лет войны с помощью канонерок удалось захватить грузовые суда из конвоев и победить британские военно-морские бриги, хотя они не были достаточно сильны, чтобы одолеть большие фрегаты и линейные корабли.