Не лучшим образом использовала власть и талант Н.Н. Хладовского. В должности старшего офицера крейсера "Рюрик" он погиб с кораблем в бою в августе 1904 г. Не нашлось в ГМШ дела и признанному специалисту в области стратегии и тактики Н.Л. Кладо. Из Владивостока, где он был назначен в штаб командующего Н.И. Скрыдлова, его перебросили в штаб командующего 2-й эскадрой, затем в комиссию по "гулльскому инциденту". "За резкие и неуместные суждения относительно Морского министерства", высказанные в газете "Новое время" от 24 марта 1905 г., ему со строгим выговором 1 апреля 1905 г. поручили вооружение и командование речными (на Амуре) пароходами на театре военных действий. За очередные резкие критические замечания в адрес тормозящего данные ему поручения ГМШ Н.Л. Кладо уже 29 апреля получил предписание принять должность старшего офицера крейсера "Громовой". Отказ от этого назначения привел к исключению его со службы 2 мая 1905 г.
В таких условиях трудно было заниматься высокой стратегией, но Н.Л. Кладо, не участвуя в военных действиях, сумел повлиять на них своими обширными публицистическими выступлениями. Его статьи в либеральной газете "Новое время" с ежедневными обзорами хода войны на море и анализом стратегии и тактики сторон (29 января-14 апреля 1904 г.), предложения об усилении эскадры З.П. Рожественского (в серии статей от 11-17 ноября 1904 г. под названием "После ухода Второй эскадры Тихого океана") и уже совсем открытое обличение косности Морского министерства (в № от 24 марта 1905 г.) вызвали широкий всплеск общественного мнения и составили невиданное еще событие в жизни России.
Весьма объемистые, занявшие стр. 310-484 во втором издании монографии "Современная морская война" (С.-Пб, 1905 г.), две первые статьи составляли беспрецедентный по ширине охвата обзор всех почти факторов, влиявших на ход войны и ее результаты, анализ русской кораблестроительной программы, действий русского флота, сравнение его сил с японскими и средства их уравновешивания, которые могут позволить добиться победы на море. По существу, Н.Л. Кладо, оставленный в стороне от высокой стратегии, выполнил ту работу Морского генерального штаба, от которой упорно уклонялась власть. Уже в статье от 2 февраля, дипломатично воздерживаясь от обличительного пафоса, Н.Л. Кладо продемонстрировал России и миру очевидный маразм русской власти. Этот вывод напрашивался из приведенного в статье того факта, что русская программа судостроения 1898 г. двумя годами отставала от совершившегося в 1902 г. – строго по плану-завершения программы Японии. "Вот она и рассудила, – писал Н.Л. Кладо, – неужели ей ждать окончания нашей кораблестроительной программы, т.е. конца 1905 г., когда русские морские силы будут иметь значительное преимущество перед японскими и когда, следовательно, война для нее немыслима". Имея, по подсчетам Н.Л. Кладо, полуторное материальное превосходство в силах флота и огромное преимущество в обеспечении его ремонтными средствами и системе базирования, Япония и развязала войну.
В причины беззаботности русских властей перед угрозой войны Н.Л. Кладо не вдавался и лишь для утешения публики приводил (в статье от 10 февраля) мнение "Правительственного вестника" о том, что миролюбие русского правительства "делало невозможным заблаговременную подготовку к войне" ("Современная морская война", 1905, с. 332,335). Не решившись, в силу законов субординации, выступить до войны с предостережением об опасном состоянии и неготовности флота, Н.Л. Кладо с каждой новой статьей ощущал, насколько события под Порт-Артуром все менее поддаются тщательно подбиравшимся им научным объяснениям. Молчанием пришлось обойти причины, по которым крейсер "Варяг" оказался заперт в ловушке Чемульпо и должен был героически, но бесцельно погибнуть. Слова о высоком "нравственном влиянии" на неприятеля этого боя не могли, конечно, заглушить очевидно напрашивающийся вывод о головотяпстве высшего командования, погубившего "Варяг". Вряд ли мог Н.Л. Кладо удовлетворять и порядок использования народных средств, поступавших "на Государево дело" усиления флота. Как теперь становится ясным, деньги эти на ускоренную достройку броненосцев употреблены не были.