Перестройка в СССР и изменение политики в отношении Афганистана.
В середине 1980-х гг. в СССР началась перестройка, во внешней политике восторжествовало «повое политическое мышление». В феврале 1986 г. в докладе на XXVII съезде КПСС новый Генеральный секретарь ЦК КПСС М.С. Горбачев сообщил делегатам о выработке совместно с афганской стороной плана поэтапного вывода советских войск, который будет приведен в исполнение сразу же после достижения политического урегулирования. Советское руководство разочаровывается в политических способностях и возможностях Б. Кармаля и считает, что его необходимо заменить более жестким, решительным и преданным Советскому Союзу лидером. Выбор пал на М. Наджиба (Наджибуллу) — «парчамиста» возглавлявшего органы государственной безопасности страны. Советское руководство надеялось, что с его приходом на первые посты начнется, наконец, практическая работа по нормализации обстановки в стране.Уход Кармаля.
В мае 1986 г. состоялся XVIII пленум ЦК НДПА, на котором Б. Кармаль был обвинен в злоупотреблении алкоголем. Его освободили от должности генерального секретаря ЦК НДПА, оставив на посту председателя Революционного совета, по ненадолго. В ноябре 1986 г. на XX пленуме ЦК НДПА была «удовлетворена просьба» Б. Кармаля об освобождении его ото всех других ответственных постов. Оказавшись не у дел, Б. Кармаль с семьей выехал в Советский Союз. Через несколько лет он скончался от рака.Новый руководитель Афганистана начал свою деятельность с традиционной в таких случаях перетасовки кадров. Все работавшие с Б. Кармалем были сняты с должностей, многие из них оказались в тюрьмах или в изгнании. Однако довольно скоро М. Наджибулла прекратил репрессии. Угроза падения режима НДПА заставила объединиться партийно-политических лидеров разных групп и взглядов вокруг М. Наджибуллы.
Курс на «примирение».
В декабре 1986 г. чрезвычайный пленум ЦК НДПА официально провозгласил новый курс руководства ДРА на «национальное примирение». Как отмечалось на пленуме, «национальное примирение — это этап развития национально-демократической революции, особый вид политическою компромисса, при котором в одно неразрывное целое сливаются задачи установления демократического строя, прекращения войны и ускорения социально-экономического развития в условиях многопартийности, коалиционных форм правления, многоукладности в хозяйственной жизни».3 января 1987 г. Революционный Совет Демократической Республики Афганистан принял Декларацию «О национальном примирении», в соответствии с которой с 15 января 1987 г. армии и силам безопасности было предписано прекратить все наступательные операции против формирований вооруженной оппозиции. Лидеры оппозиции в первой половине января после серии совещаний принимают решение не идти на компромиссы с правительством. Наоборот, они пытаются активизировать боевые действия. Весной 1987 г. отряды вооруженной оппозиции совершают несколько «акций устрашения» — демонстративные нападения на приграничные территории СССР и их артиллерийско-мииометный обстрел. В этих условиях вынуждены были активизировать свои действия и советские войска. Им удалось провести ряд успешных операций, в частности — операцию «Магистраль» по деблокаде дороги Гардез-Хост.
Новая конституция.
Тем временем новое правительство Афганистана собирают «Лойю Джиргу» — традиционный в Афганистане съезд представителей различных слоев населения страны: народов, племен, политических партий, социальных групп и т. д. «Лойя Джирга» утвердила текст новой конституции и новое название страны — Республика Афганистан (РА).К концу 1987 г. стало ясно, что все усилия правительства но реализации плана национального примирения были малоэффективными. Большая часть «воссозданных» тогда организаций оказались маловлиятельными и нежизнеспособными. В то же время вооруженная оппозиция не шла навстречу предложениям правительства и продолжала вооруженную борьбу. Все это стимулировало руководство СССР к активизации усилий по политическому решению афганской проблемы и выводу советских войск из Афганистана.
Женевские соглашения по Афганистану. Вывод советских войск.
14 апреля 1988 г. после длительных переговоров в Женеве при посредничестве ООН министрами иностранных дел Афганистана и Пакистана был подписан пакет документов, позволявший в принципе положить конец кровопролитию. Гарантировалось прекращение вооруженного или иного вмешательства в дела Афганистана извне. СССР взял на себя обязательства вывести войска из Афганистана в девятимесячный срок, начиная с 15 мая 1988 г. Лидеры вооруженной оппозиции заявили, что подписанный в Женеве договор их не касается, и они продолжат вооруженную борьбу.