По другой легенде, в 1703 году царь Петр I, присматривая место для начала строительства новой столицы, высадился на небольшом острове. Но поскольку место было болотистое, он зачерпнул ботфортом воду. Пётр снял промокший сапог и положил его на траву сушиться. Царь осмотрел остров, стал обуваться и обнаружил, что во время просушки в ботфорт заскочил заяц. Пётр I рассмеялся, вытряхнул зайца и произнес: «Быть этому острову Заячьим!»
На одной из свайных опор Иоанновского моста с недавнего времени «поселился» бронзовый зайчик – памятник длинноухим, в большом количестве населявшим некогда невские берега.
Крепость Санкт-Питербурх (крепость Святого Петра) должна была закрыть вход вражеским судам со стороны Большой и Малой Невы. Вскоре крепость была переименована в Петропавловскую, по названию построенного на её территории собора, а название «Санкт-Петербург» перекинулось на Березовый, или Городовой, остров (ныне Петроградский).
В центре крепости расположен Петропавловский собор. Многоярусную колокольню собора венчает знаменитый высокий шпиль с флюгером в виде фигуры летящего ангела с крестом. Со временем собор стал усыпальницей членов императорской фамилии. Здесь похоронены русские императоры, начиная от Петра I.
В 1779–1785 годах северную часть крепости облицовывают гранитом. К этому времени левый берег Невы здесь уже был одет в гранит. По легенде, Екатерина II, выглянув однажды в окно Зимнего дворца, возмутилась «простецким видом» крепостных стен и тут же распорядилась привести их в соответствующий вид. Пожелание её, конечно же, выполнили, однако всё, что не видно из кабинетов Зимнего дворца, так и осталось красного цвета.
Для посетителей крепость впервые была открыта в начале XIX века, в период царствования императора Александра I. Постепенно крепость становилась также и мемориальным музеем. Сейчас на территории Петропавловской крепости находится Музей истории города.
Кстати, в акватории Невы у Заячьего острова 28 июня 1968 года появилась шхуна под алыми парусами. Так был впервые проведён праздник «Алые паруса», ставший ежегодным для выпускников школ и профтехучилищ города. Название праздника связано с одноимённой феерией писателя Александра Степановича Грина. В первые годы проведения праздника неотъемлемой частью его был приход в Неву шхуны под алыми парусами.
Одна из трагических историй Петропавловской крепости связана с именем так называемой княжны Таракановой. Это ей Заячий остров обязан появлением первого дамского привидения.
У неё было много имён – госпожа Франк, Шель, Тремуйль, Али-Эмете, принцесса Владимирская, Элеонора, принцесса Азовская, принцесса Елизавета Владимирская – всероссийская княжна. А вот именем Тараканова она никогда не пользовалась, так её назвали историки, пытаясь докопаться до истины. Никто точно не знает, кто она. Можно только догадываться, сколько было лет этой таинственной женщине и откуда она родом.
По словам самой княжны, она была дочерью императрицы Елизаветы Петровны и её фаворита Алексея Разумовского.
Все без исключения отмечали необыкновенную внешность княжны. Своей красотой она покоряла сердца богатых поклонников. И успешно опустошала их кошельки.
В 1774 году княжна, поддерживаемая поляками (есть версия, что это вообще был «польский проект»), объявила себя сестрой Пугачёва и претенденткой на российский престол. Она заявляла, что Елизавета I передала ей права на престол, а Петра III обязала воспитать царевну, однако немилосердный монарх отправил её в сибирские леса, откуда под покровом ночи она бежала в столицу донских казаков. Её преследовали и пытались отравить, поэтому ей пришлось бежать в Персию. Там она не только жила в роскоши и неге, но и занималась с педагогами. Самозванка пыталась заручиться поддержкой многих влиятельных людей, однако её обращения не имели никакого успеха.
В то же время в России пристально интересовались подозрительной особой, претендующей на святая святых – трон. В конце концов, Екатерина приказала «схватить бродяжку» и доставить в Россию.
По поручению Екатерины II граф Алексей Орлов увлёк молодую женщину, а потом с помощью клятв и обещаний заманил её в Россию и сдал властям. Жестоко обманутая красавица была заточёна в Петропавловскую крепость. К тому времени она была беременна от Орлова, но её доводили до отчаяния постоянными допросами, нечеловеческими условиями. И всё же, сознавая безысходность положения, она так и не раскрыла тайну своего рождения.
Согласно петербургской легенде, во время знаменитого петербургского наводнения 1777 года камера, где содержалась княжна, была затоплена поднявшимися водами разбушевавшейся
Невы. Узницу могли спасти, но, мол, Екатерина II дала приказ не делать этого. И с тех пор тень несчастной княжны бродит по острову, о чём свидетельствуют многие очевидцы.