Восстание захватило индийское правительство неожиданно, и власти хотели энергией и отвагой загладить свои ошибки. Хотя стояло самое жаркое и нездоровое время года, правительство, не дожидаясь даже подкреплений, затребованных из метрополии, организовало из европейских солдат и горсти сикхов смелую экспедицию против Дели и другую — против Коунпура и Лукноу. 8 июня 8000 английских солдат подошли к стенам Дели, где засели более 30 000 мятежников. 14 августа прибыли подкрепления из Пенджаба. 14 сентября был предпринят штурм, длившийся целую неделю. Приходилось последовательно брать забаррикадированные улицы. Здесь пал командующий пенджабской армией, и половина наличного состава английских войск выбыла из строя. По взятии города один офицер добровольческого отряда в сопровождении нескольких кавалеристов арестовал потомка Великого Могола в нескольких километрах от города в ограде, где находились могилы его предков. Он там укрылся. Его привели к английскому генералу. На следующий день тот же офицер явился за сыновьями султана и, будучи окружен враждебной толпой, желавшей освободить пленников, перестрелял их всех из пистолета. Все население Дели было на некоторое время изгнано из города; индусам вскоре позволили вернуться, по по отношению к мусульманам обнаружили больше злопамятства. Город и его округ целый год оставались на осадном положении. Здесь было совершено множество казней, часто бесчеловечных: повстанцев привязывали к дулам заряженных пушек, из которых затем стреляли.
Экспедиция против Коуппура и Лукноу оказалась более трудной и вначале не увенчалась успехом. 7 июля Гэвелок выступил из Аллахабада с отрядом европейцев приблизительно в тысячу человек и, несмотря на палящий зной, за девять дней прошел 200 километров, отразив при этом четыре неприятельских нападения. 17-го войска заняли Коунпур, только что покинутый Нана-сагибом, который перед уходом велел умертвить женщин и детей, еще остававшихся в его руках. Гэвелок перешел Ганг и без замедления двинулся на Лукноу. Но в его войсках вспыхнули дизентерия и холера; он не смог пробить себе дорогу сквозь полчища мятежников, далеко превосходивших его численностью и располагавших сильной артиллерией, и принужден был вернуться в Коунпур. Здесь к нему присоединился небольшой отряд под начальством сэра Джемса Утрама. Утраму и Гэвелоку удалось с 3000 человек прорваться в резиденцию Лукноу, где горсть англичан оборонялась уже три месяца (26 сентября). Этот небольшой вспомогательный отряд был, в свою очередь, осажден полчищами повстанцев. Наконец, генерал Колин Кемпбелл, присланный из Англии для руководства военными операциями, выручил осажденных (16 ноября) и отступил вместе с ними, оставив Лукноу в руках мятежников. Он привел в Коуннур 400 женщин и детей и более 1000 раненых и больных.
Весной 1858 года сэр Колин Кемпбелл при поддержке непальских гурхасов взял один за другим города Ауда. 19 марта был окончательно занят Лукноу. Нана-сагиб скрылся в Непал. В январе 1859 года сопротивление было окончательно сломлено. В то же время войска, посланные из Бомбея, покорили мятежные княжества центральной Индии (1858–1859).
1 ноября 1858 года лорд Каннинг обещал амнистию всем мятежникам, не замешанным в убийстве английских подданных, а 8 июля 1859 года был провозглашен мир на всем протяжении Индийского полуострова. Затем лорд Каннинг совершил объезд вассальных князей, принимая от них изъявления покорности, причем сообщал им, что отныне им снова даровано право назначать себе в наследники приемных сыновей.
Переход Индии в непосредственное ведение английского правительства.
Последствием мятежа было упразднение Компании. Эта мера не явилась неожиданностью: Компанию давно уже обвиняли в том, что она чрезмерно эксплуатирует Индию. С 1813 года парламент, возобновляя ее привилегию, каждый раз лишал ее каких-нибудь льгот. Последний раз, в 1853 году, привилегия была возобновлена не на двадцать лет, как обыкновенно, а на неопределенный срок, предел которого мог быть установлен парламентом. В 1858 году Компания была упразднена, и Акт об улучшении управления Индией установил непосредственное коронное управление страной. Совет директоров был распущен. Отныне Индией должен был заведывать от имени королевы особый государственный секретарь, независимый от министра колоний, при содействии совета из 15 членов, другими словами — просто было расширено старое контрольное бюро. Индийский генерал-губернатор, называемый отныне (неофициально) вице-королем, назначается королевой и управляет при посредстве исполнительного совета, в который входят начальники отдельных ведомств, — обыкновенно, и вполне справедливо, называемые министрами, и законодателгного совета, состоящего, кроме них, еще из нескольких лиц по назначению вице-короля. Последний не обязан соглашаться с мнением большинства своих советников.