25 января 1138 г. Анаклет II скончался. Обстоятельства его безвременной и таинственной кончины всегда тщательно замалчивались, и теперь уже их невозможно восстановить. Он был тайно погребён своими сторонниками, которые опасались надругательства над телом усопшего друга. Жизнь этого папы, вначале столь многообещающая, оказалась печальной. В течение тех восьми лет, когда он занимал престол св. Петра, он страдал под потоками брани и оскорблений, изливаемых на него врагами под предводительством Бернара Клервоского. Эти обвинения повторялись на протяжении многих веков апологетами католицизма и биографами святого Бернара; во многих современных справочных изданиях имя Анаклета или подвергается поношению, или пропускается. Тем не менее, как пишет Д. Норвич, если начало карьеры Анаклета и было
После смерти Анаклета схизма продолжалась еще некоторое время. Верные ему кардиналы не отказались сразу от борьбы. В марте 1138 г. при поддержке Рожера II противники Иннокентия избрали на папский престол кардинала Григория Конти ди Сан-Клементе, принявшего имя Виктора IV (3.1138–29.5.1138).
Но этот антипапа не пользовался и долей популярности своего предшественника. Немногие римляне, которые его поддерживали, вскоре были перекуплены Иннокентием. Виктор продержался менее двух месяцев: 29 мая 1138 г. антипапа тайно покинул своих сторонников, переплыл на левый берег Тибра и покорился Иннокентию II.Получив крупную денежную сумму, братья Анаклета вместе с прочими римлянами присягнули Иннокентию как папе и своему государю. Дом Пьерлеони демонстрировал полную лояльность победившему понтифику. Благодаря избранной политике родные покойного антипапы сохранили свою власть при папском дворе, и Иннокентий даже отличил их почестями и пожалованием должностей.
Всегда реально мыслящий Рожер Сицилийский не видел смысла продолжать войну со Святым престолом. Король публично признал Иннокентия законным понтификом и повелел всем своим подданным сделать то же. Но злопамятный Иннокентий решил сломить нормандскую монархию и выступил против сицилийского короля войной. Собрав войско, в состав которого вошли многие знатные римляне, Иннокентий направился на юг, чтобы начать еще менее обдуманно, чем Лев IX и Гонорий II, неравную борьбу. Папа верхом возглавлял свою армию.
Рожер снова владел южными провинциями, отвоеванными после смерти императора Лотаря. Он заманил папу в ловушку и взял в плен. Иннокентий повторил судьбу св. Льва, так глубоко уязвленного посягательством на священную особу папы. Безжалостный нормандец принудил папу подписать в Миньяно (1139) договор, в силу которого все захваченные земли оставались за ним. Во время этой борьбы король не стеснялся вооружать против христиан своих сицилийских сарацин.
Подписание Иннокентием II договора с королем Сицилии чрезвычайно разгневало Бернара Клервоского. Он и без того часто имел основания быть недовольным этим папой, которого с таким трудом утвердил на престоле. Он позволял себе жестко выговаривать ему за все его прегрешения. С горечью Бернар отзывался о нем в письме к его преемнику, в котором призывал защитить добрые дела своего предшественника и
И владение Вечным городом не приносило Иннокентию ожидаемого удовлетворения. За годы схизмы в Риме усилились республиканские настроения. Проводником этих веяний стал Арнольд Брешианский, ученик Абеляра, монах августинского ордена, выступавший за возврат духовенства к апостольской бедности и восстановление древних городских свобод.