При возвращении из Норвегии «Лютцов» к востоку от Скагена атаковала английская подлодка. Взрыв торпеды нанес серьезные повреждения: корабль потерял руль и винты. Последующие атаки подводных лодок были отбиты силами авиации и корабельным эскортом. На помощь были срочно направлены буксиры, и корабль отбуксировали на ремонт в Киль без новых происшествий. Предполагалось, что ремонт должен был занять девять месяцев, соответственно в течение длительного времени корабль нельзя было использовать для рейдов против судохозяйства противника.
«Гнейзенау», отправленный в рейд в исландские воды, также был торпедирован подлодкой 20 июня 1940 г. у норвежского побережья, так что теперь оба линейных крейсера вышли из строя на несколько месяцев. Для активных действий остался только тяжелый крейсер «Хиппер». Но из-за чрезмерного потребления топлива этот корабль не мог долго находиться в море. Кроме того, у него были проблемы с котлами высокого давления. Такие же котлы стояли на новых эсминцах. Они обеспечивали высокое давление и температуру пара, но, как часто бывает с техническими новинками, были не лишены «детских болезней». В результате в каждой операции, где участвовали эти корабли, вскоре начинался озабоченный подсчет расстояния до ближайшей базы или танкера и поиск способов сохранить быстро уменьшающиеся запасы топлива на случай боя.
25 июля 1940 г. «Хиппер» покинул Тронхейм, чтобы осуществить поиск в Баренцевом море между Северной Норвегией и островом Медвежий и районе к западу от Шпицбергена. Английских судов повстречать не удалось, но были обнаружены несколько финских и русских. По политическим причинам русские суда не обыскивались, тогда как одно финское судно было арестовано. Не добились больших успехов три небольших вспомогательных корабля, которые контролировали каботажные перевозки в этих водах. Это был единственный вид действий, которые корабли типа «Хиппера» могли совершать в то время года, поскольку в высоких широтах у них не было шансов пройти незамеченными мимо Исландии, чтобы попасть в Атлантику.
Первое призовое судно, захваченное вспомогательным крейсером, прибыло в один из портов в Бискайском заливе 7 июля. В августе рейдер № 45 («Комет») под командованием капитана 1-го ранга Роберта Эйссена начал рискованное плавание из Норвегии в Тихий океан по Северному морскому пути. Русские оказывали помощь, предоставляя лоцманов и ледоколы до Новосибирских островов, но 1 сентября они прекратили ее и предложили Эйссену повернуть обратно. Он не подчинился и прошел оставшиеся 600 миль до Берингова пролива без сопровождения и лоцманов.
Во второй половине апреля большинство подводных лодок было отозвано из Норвегии, но лишь с июня они снова стали играть заметную роль в войне против судоходства англичан. Даже в это время их число все еще оставалось ограниченным, так как ряд лодок были переведены в учебную флотилию для обучения новых экипажей.
Поэтому численность лодок боевого назначения, находившихся в строю в первые два месяца войны, – 39 – была превышена лишь в июне 1941 г. и с той поры начала увеличиваться. Летом и осенью 1940 г. в море находилось обычно от 10 до 15 подводных лодок, из них две трети в главной операционной зоне к западу от Ирландии и Шотландии, где торговые пути в Англию сходились к Северному проливу. Маршрут южнее Ирландии, ведущий к крупным портам на западе Англии, не использовался британцами, поскольку он подходил слишком близко к недавно захваченным немецким базам на северо-западе Франции. Падение Франции сократило дорогу на позиции для подводных лодок приблизительно на 250 миль, что, в свою очередь, позволило увеличить их число в этом жизненно важном районе.
Но такого числа лодок было недостаточно, чтобы контролировать все подходы к Северному проливу. На маршруте ходило еще много одиночных транспортов, представлявших собой сравнительно простые цели для подлодок. Однако, чтобы добиться больших результатов в кратчайшие сроки, необходимо было атаковать конвои, которые не имели достаточного охранения, и даже одиночная лодка имела хорошие шансы на удачную атаку. По этой причине командование подводных сил стремилось расположить лодки так, чтобы обнаруженные конвои могло бы атаковать как можно больше субмарин. В этом районе надводных патрульных сил было все еще недостаточно. Воздушное патрулирование доставляло больше неприятностей, хотя громоздкие гидросамолеты «сандерленд» обычно засекали раньше, чем они сами могли обнаружить подводные лодки.