Для активизации и координации работ по розыску и ликвидации украинских националистов в Министерстве госбезопасности Украины было создано управление 2-Н. Возглавлял управление заместитель министра госбезопасности республики, и он же руководил «Оперативной группой» во Львове, координирующей все антиоуновские мероприятия в регионе. В Управлении 2-Н каждый отдел отвечал за определённый участок. Первый отдел осуществлял поиск членов Центрального Провода ОУН и основных краевых проводов, второй вёл разработку низших проводов и «легальной сетки» ОУН, третий отвечал за весь комплекс мероприятий по противодействию ОУН в восточных областях Украины, а четвёртый занимался «мельниковцами» и другими националистическими организациями, не подчинявшимися Бандере и Шухевичу. В Управлении, кроме того, действовали подразделения связи, материального обеспечения и оперативного учёта. Первый отдел возглавил подполковник Шорубалка, вскоре назначенный заместителем начальника Управления 2-Н.
22 апреля 1947 г. министр государственной безопасности СССР Абакумов издал приказ № 00207, которым предписывалось министру госбезопасности УССР Савченко и начальникам УМГБ западных областей Украины «приложить все усилия в целях нанесения решительного удара по националистическому подполью и его вооружённым бандам». Министр госбезопасности Украины Савченко в своём приказе потребовал «обеспечить точное и неукоснительное выполнение всем личным составом приказа министра госбезопасности СССР № 00207». Он приказал начальникам областных управлений МГБ и командирам частей войск МГБ «активизировать агентурно-оперативную работу по ликвидации руководящих оуновских звеньев; установить между собой постоянный контакт для обмена информацией и повседневный личный контроль над всеми проводимыми мероприятиями по делу "Берлога" по розыску и ликвидации членов Центрального провода ОУН Р. Шухевича, В. Кука, Р. Кравчука и их связей».
По этому приказу весь оперативный состав должен был «решительно улучшить работу с агентурой и максимально её использовать, предварительно очистив от двурушников и дезинформаторов, и приняв меры к систематическому пополнению её за счёт новых смелых и целеустремлённых вербовок». Чекистам Украины предлагалось «активнее использовать имеющиеся специальные группы агентов-боевиков и агентов-боевиков-одиночек по внедрению их в бандитско-оуновское подполье для захвата или ликвидации главарей». Савченко требовал также повысить качество следственной работы по делам захваченных и арестованных участников подполья и «взять упор на быстрое и полное выявление их связей и мест укрытий их сообщников и главарей». При этом рекомендовалось находящихся под следствием «арестованных участников бандитско-оуновского подполья, и особенно главарей, активно разрабатывать через внутрикамерную агентуру».
Рекомендация министра госбезопасности УССР по активной разработке арестованных через внутрикамерную агентуру сработала. Вскоре именно благодаря использованию внутрикамерных агентов чекистам удалось получить информацию о месте нахождения Шухевича, что и решило его судьбу.
Между тем зона охоты на «Волка» расширилась и охватила территорию всей страны. 10 марта 1948 г. заместителем министра госбезопасности СССР была разослана совершенно секретная ориентировка по розыску Романа Шухевича. Она была адресована министрам госбезопасности союзных и автономных республик, начальникам управлений МГБ краёв и областей, начальникам управлений и отделов контрразведки МГБ групп войск, военных округов, флотов и флотилий, начальникам управлений и отделов охраны МГБ на железнодорожном и водном транспорте.