Обе "Берты" – и первая, и вторая -выпускались в четырех вариантах (субмодификациях), отличавшихся оснащением так называемых "комплектов заводской установки" (Umrust-Bausatze). Базовая комплектация обозначалась Ju-87B-1/U1 (Ju-87B-2/Ul) и практически ничем не отличалась от вышеописанных модификаций В-1 и В-2. Самолеты с радиокомпасом Peil G IV, узнаваемые по обтекателю антенны снизу под хвостом самолета, обозначались как B-1/U2 или B-2/U2. После "битвы за Британию" и высоких потерь Ju-87 в этой кампании появился вариант U3, отличавшийся от базового усиленным бронированием. Сначала это была бронеспинка пилота, включенная в силовую схему противокапотажного шпангоута. Позже установили броню на турели стрелка-радиста, затем – бронестекло над пулеметом и бронеперегородку, прикрывавшую стрелка-радиста с хвоста. Этот вариант легко узнать по бронированным скосам задней части стрелковой установки и наличию сплошной бронеплиты между членами экипажа.
Последний вариант U4 выделялся среди всех машин наличием лыжного шасси, что свидетельствует о серьезности намерений немцев применять их в СССР и в Арктике. Модель Ju-87B-2/U4 прошла весь комплекс испытаний с положительной оценкой, но в войсках практически не использовалась.
Юнкерс Ju-87B-2lU4 на лыжном шасси.
Применение "штук" в Северной Африке и на Средиземноморье потребовало установки оборудования для эксплуатации машины в условиях пустыни и влажного климата. Наравне с другими немецкими машинами, летавшими на европейских и африканских "курортах", Ju-87 получили специальные противопыльные фильтры для предотвращения попадания пыли и грязи в нагнетатели и добавку "Тгор" в обозначении, например Ju-87B-2/Trop. Вместе со стандартными Ju-87B-2 такую модификацию поставляли итальянцам.
Основным недостатком "Берты", никак не гармонировавшим с ее высокой эффективностью боевого применения, была слишком малая дальность, особенно заметная во время "битвы за Британию" и оккупации Крита. Для увеличения радиуса действия попытались использовать дополнительные топливные баки. Дальний вариант обозначался индексом "R" (Reichweite – дальность) и получил кличку "Рихард" (или "Рудольф"), такие машины строили одновременно с "Бертами". С конца 1939 г. (по другим данным – с весны 1940 г.) выпускали Ju-87R-1, практически идентичные В-1, но с дополнительными бензобаками в консолях крыла и двумя подвесными 300-л бензобаками. В случае необходимости на эти узлы подвешивали бомбы. В результате вариант R-1 по сравнению с В-1 имел вдвое большую дальность -1400 км.
Одновременно с R-1 завод в Темпельхофе наладил выпуск модификации R-2 на базе В-2. Взлетная масса увеличилась почти на тонну, а дальность достигала 1250 км. Некоторые самолеты оснащались новым двигателем Jumo211H. Весной 1940 г. во время оккупации Норвегии Ju-87R входили в состав I/StGl. Поскольку боевые действия "штук" против британского флота и конвоев продолжались, "Рихарды" считались "техникой особой секретности", цензоры на публикуемых в печати фотографиях тщательно ретушировали все признаки наличия подвесных баков.
Модель R-3 отличалась от предыдущих наличием буксировочных устройств для буксировки десантных планеров DFS-230 на большие расстояния. Иногда считают, что главным отличием R-3 от R-2 было наличие дополнительного радиооборудования (радиополукомпас Peil G IV). Общий выпуск "Рихардов" составил 100-150 машин, а последним из них стал Ju-87R-4 – тропический вариант Ju-87B-2 с противокоррозийным покрытием и электропроводкой повышенной влагоустойчивости.
Ju-87R-2 с подвесными баками использовался и для дальних разведывательных полетов.
Ju 87R-2 над Средиземным морем
Подвеска 300-л дополнительных баков под крыло Ju 87R
Соперничество с "владычицей морей" Англией за господство на море привело Гитлера к мысли о необходимости создания океанского флота. Планы расширения германских ВМС (Kriegsmarine) предполагали строительство двух авианосцев – "Граф Цеппелин" и "Петер Штрассер". В результате уже в 1938 г. появилось решение о включении соединения палубных пикировщиков, обозначенного 4 Tragergruppe 186 (или 4.(Stuka)/ TGrl86) в состав авиационного крыла "авианосца А" ("Граф Цеппелин"). В Темпельхофе по срочно разработанным фирмой чертежам в марте-апреле 1939 г. переделали два серийных Ju-87В-1. Так появился Ju-87C ("Casar" – "Цезарь"), отличавшийся наличием кронштейнов для водила катапульты, посадочного гака и вручную складывающихся консолей. Общий размах крыльев при этом уменьшили до 13,19 м. Размеры машины со сложенными крыльями определялись размахом 5-м хвостового оперения. Для увеличения дальности по аналогии с "Рихардом" предусмотрели 300-л подвесные баки и дополнительный 48-л маслобак.