Велись широкомасштабные работы и по модернизации основного боевого самолета турецких ВВС - F-4E "Фантом" II. В 1996 г. правительство Турции выбрало израильскую фирму IAI (точнее - ее отделение "Лахав") в качестве головного подрядчика при проведении работ по модернизации 54 турецких F-4E до стандарта "Фантом" 2000 (что соответствовало израильскому варианту "Курнасс" 2000). Модернизация всех 54 "Фантомов" завершилась в 2003 г. Доработанные истребители получили новое название F-4E-2020 "Симсер" ("Simser").
В 2009-2010 гг. модернизацию прошли и 18 разведчиков - "Фантомов", получивших турецкое обозначение RF-4E "Исик" (Isik). Работы проводились под общим руководством турецкой государственной компании Aselsan, которая выступала в роли интегратора программы. Тем не менее, поставку оборудования и основные работы осуществляли израильские компании (Elta, Elbit и т.д.).
А в марте 2010 г. ВВС Турции получили первый модернизированный истребитель-бомбардировщик F-4E "Симсек" (Simsek), доработанный по схеме, близкой Isik. В общей сложности Турция намеревалась модернизировать по этой программе 16 "Фантомов".
По турецким данным, к 2012 г. в строю ВВС числилось 65 модернизированных истребителей-бомбардировщиков F-4E и 25 модернизированных разведчиков RF-4E из общего числа в 157 машин этих типов, имевшихся тогда у Турции (остальные турецкие "Фантомы" находились на консервации или использовались как источники запасных частей). По всей видимости, к началу 2016 г. все турецкие F-4 были выведены в резерв и поставлены на консервацию.
В Турции долго обсуждали уничтожение Сирийской ПВО 22 июня 2012 г. разведывательного самолета ВВС Турции RF-4E (по всей видимости, речь идет о RF-4E Isik), вылетевшего, якобы, для безобидной "калибровки радиотехнического оборудования ПВО Турции". Самолет исчез с экранов РЛС спустя полтора часа после взлета, над Средиземным морем, юго-восточнее приграничной с Сирией провинции Хатай. По заявлению МИД Сирии, "Фантом" II, вошедший в сирийское воздушное пространство, был уничтожен огнем малокалиберной зенитной артиллерии. Настоящий международный скандал вызвало уничтожение турецким истребителем F-16 российского бомбардировщика Су-24 в ноябре прошлого года.
В настоящее время основной боевой силой турецких ВВС являются 168 многоцелевых истребителей Локхид Мартин F-16C и 40 учебно-боевых двухместных машин F-16D. Сообщается, что все они изготовлены по американской лицензии в Турции, а потому носят местные названия Tusas F-16C и Tusas F-16D соответственно. Впрочем, не исключено, что в это число попала и часть самолетов F-16C/D "турецко-американского производства", построенных в США и лишь окончательно собранных в Турции. По меньшей мере, часть этих истребителей снабжена двумя конформными топливными баками, которые несколько ухудшают летные характеристики истребителей, но зато заметно улучшают их характеристики по параметру "дальность-боевая нагрузка".
Самолеты "чисто турецкого производства", соответствующие уровню Block 52, могут нести КАБ типа JDAM (с коррекцией по GPS), УПАБ типа AGM- 154 JSOW, ракеты класса "воздух-воздух" средней дальности AIM-120C-7 AMRAAM, ракеты малой дальности AIM-9X/X-II "Сайдуиндер", а также противокорабельные УР типа "Гарпун".
Следует сказать, что на авиабазе Инджирлик, находящейся в совместном распоряжении МО Турции и НАТО, заскладировано 90 американских термоядерных бомб типа В61. В случае начала ядерной войны 40 этих боеприпасов (находящихся в мирное время под контролем США) должны быть, в рамках единого плана НАТО, переданы в распоряжение вооруженных сил Турции. В качестве носителей В61 рассматриваются многоцелевые истребители турецких ВВС F-16C, летчики которых проходят специальные тренировки по применению ядерного оружия.
Кроме этих, вполне современных машин (приближающихся к уровню самолетов поколения "4+"), в ВВС Турции продолжают "дослуживать" 26 одноместных истребителей второго поколения NF-5A и 15 "спарок" NF-5B.
Военно-транспортная авиация ВВС Турции представлена сегодня шестью средними военно-транспортными самолетами американского производства Локхид С-130В/Е "Геркулес", семью новыми BTC Локхид Мартин C-130J/J-30 "Геркулес"II и 18 франко-германскими средними военно-транспортными самолетами Трансалл C-160D, полученными из наличия ВВС Германии.