Напрашивался вариант резкого сокращения боевого состава штурмовой авиации - почти вдвое, что позволяло в приемлемые сроки оснастить штурмовые авиаполки новой техникой. К тому же это хорошо вписывалось в предлагаемую правительством и ЦК КПСС программу сокращения Вооруженных сил СССР. Но и в этом случае боевые возможности штурмовой авиации все равно понижались, хотя и при меньших расходах на перевооружение.
Надо полагать, эти обстоятельства и возможные в связи с этим действия обсуждались и учитывались при формировании итоговой позиции министерства обороны, авиапромышленности и правительства не только по вопросу прекращения серийного производства Ил-40, но и самой ликвидации штурмовой авиации.
18 апреля 1956 г. специальным постановлением Совета Министров СССР с формулировкой «в связи с оснащением Вооруженных сил СССР новыми видами оружия» серийное производство штурмовика Ил-40 прекращалось, а директивой МО СССР от 20 апреля была ликвидирована и сама штурмовая авиация.
Здесь следует иметь в виду, что в период с августа 1953 г. по октябрь 1954 г. в СССР было проведено восемь испытаний тактических ядерных боеприпасов в «категории» авиационных бомб (мощностью от 0,03 до 28 кт) для применения фронтовыми ударными самолетами. Тогда же на вооружение ВВС был принят ядерный боеприпас РДС-4, носителем которого стал фронтовой бомбардировщик Ил-28. Кроме этого, 16 марта 1956 г. успешно подорвали РДС-41 для первого советского ядерного снаряда. То есть тактическая авиация и ствольная артиллерия получали ядерную компоненту. Становилось возможным путем «простого» применения по войскам противника ядерного боеприпаса «прорубить окно в Европу» для ввода в прорыв танковых армий.
Непосредственная авиационная поддержка войск на поле боя в формате Великой Отечественной войны и первых послевоенных годов в глазах высшего военного и политического руководства страны в основном утратила свое значение. Авиационная поддержка войск теперь планировалась одновременно с использованием тактического ядерного и химического оружия. Применение на поле боя только обычных авиационных средств поражения фактически исключалось. Это позволяло вместо специальных самолетов-штурмовиков задействовать более универсальные истребители с ударным вариантом вооружения и фронтовые бомбардировщики. К тому же такой подход способствовал сокращению расходов на оснащение и поддержание в боеготовом состоянии ВВС, что положительно оценивалось правительством.
Как следствие принятых решений, все опытные работы по самолетам Ил-40П (с подвижным оружием), Ил-40Р (разведчик-корректировщик), Ил-40У (учебный) были приостановлены сначала приказом МАП от 16 мая 1956 г., а затем, распоряжением Совета Министров СССР от 20 июля 1956 г., полностью прекращены. Соответственно, по всем проектным работам, связанным с модификацией прицелов СПБ-40 и ПБП-6М для этих самолетов и оснащением Ил-40 реактивными системами и снарядами нового типа, предлагалось внести изменения в план опытно-конструкторских работ по вооружению и военной технике на 1956 г. «в части поставок комплектов изделий, вытекающих из настоящего распоряжения». Одновременно уничтожили весь задел по серийным самолетам Ил-40 на заводе №168, в том числе и пять первых серийных машин, на которых проводились аэродромные отработки.
К этому времени опытный самолет Ил-40-2 уже был доработан под вариант Ил-40П с подвижной пушечной установкой и системой «Гроза». Степень летной готовности Ил-40П оценивалась в 60%.
Что касается первого экземпляра Ил-40-1, то можно сказать следующее. В декабре 1954 г. самолет был законсервирован и находился на длительном хранении в ЛИИ МАП под открытым небом. Приказом МАП от 21 октября 1955 г. Ил-40-1 требовалось переоборудовать под двигатели РД-9В. Самолет предполагалось использовать для проведения исследовательских работ по выявлению причин заглохания двигателей при стрельбе из различных видов реактивного оружия.
После согласования ряда организационных вопросов Ил-40-1 22 ноября перевезли на завод №240, где начались работы по приведению самолета в летное состояние. Планировалось доработать мотогондолы под двигатели РД-9В «без выноса воздухозаборников вперед», установить двигатели с соответствующими доработками топливной и противообледенительной систем, а также демонтировать в носовой части самолета газовую камеру передней пушечной батареи. Кроме этого, намечался большой объем ремонтно-восстановительных и регламентных работ, обусловленных длительным нахождением самолета в условиях безангарного хранения: «замена резины уплотнительных элементов в гидравлических и воздушных агрегатах (окончание ресурса резины) и заменой почти всех готовых изделий по причине истечения технических регулировок и гарантийных сроков».