Лейтенант Уильям М. Баулер летел за Гринингом. Когда пересек береговую линию, понял, что оказался слишком далеко к северу от цели. Вероятное отклонение могло достигать и 100 миль. Штурман лейтенант Уильям Р. Паунд-младший потерял ориентацию и не мог определить положение самолета. Паунд предложил Баулеру лететь вдоль побережья, пока не удастся сориентироваться. За бомбардировщиком шло несколько истребителей, но они не рисковали сокращать дистанцию менее чем до 900 м. Выйдя к Токийскому заливу, Паунд сумел выяснить свою позицию и быстро выдал новый курс. Издали экипаж видел огромный пожар, вызванный бомбами Грининга. Баулер пролетел над базой морской авиации Кисаразу и попал в центр отряда самолетов, ожидавших своей очереди на посадку. Но японские пилоты не ожидали столкнуться с американским бомбардировщиком, поэтому никак не прореагировали. Баулер просто пролетел мимо. В 300 м от цели — йокогамских доков — японцы выставили аэростаты заграждения. Баулер повернул на север и тут же попал под огонь зенитной артиллерии. Чтобы выйти из-под огня, Баулер набрал высоту 330 м и перелетел через аэростаты. Тем временем бомбардир сержант Уолдо Дж. Бичер выбрал себе цель — нефтеперегонный завод в Огуре, а также прилегающие заводы и склады. Экипаж успел заметить, куда упали две бомбы. Одна взорвалась на углу крупного строения. а другая попала в ряд автомашин, выстроенных вдоль обочины дороги. Баулер повернул на юг в сторону аэростатов. Затем он снизился и над верхушками деревьев направился к острову О. По дороге Бичер из курсового пулемета обстрелял линию электропередач. Баулер повернул на юго-запад и взял курс на Китай.
Тринадцатый В-25 «Mitchell», добравшийся до Японии, пилотировали лейтенант Эдвард Э. Макилрой и лейтенант Ричард А. Ноблоч. Ни пилоты, ни штурман лейтенант Клейтон Дж. Кемпбелл не видели ожидаемых ориентиров. Кемпбелл предположил, что они оказались в ста милях к северу от Йокогамы. Макилрой повернул на юг и полетел вдоль побережья. Достигнув маяка Инубосаки, Макилрой взял вправо и перелетел над аэродромом. Зенитные батареи тут же открыли огонь. Макилрой вышел из-под огня и оказался над Токийским заливом, откуда взял курс на базу Йокосука. Вокруг В-25 начали рваться снаряды. Макилрой набрал высоту 400 м. Бомбардир Роберт К. Буржуа сбросил первую бомбу, которая попала в корабль, стоявший в сухом доке. Жертвой оказался авианосец, переделанный из транспорта. Взрыв опрокинул корабль и вызвал пожар. Вторая бомба поразила большой подъемный кран в районе докоз. Зажигательная бомба упала на жилой район, вызвав пожар. Дик Ноблоч непрерывно фотографировал. Эти снимки были единственными, уцелевшими до конца рейда. Экипаж отметил столбы дыма в районе йокогамских доков. Макилрой полетел вдоль побережья, а потом взял курс на Китай.