Останки поместили в металлическую бочку, облили бензином и сожгли у стен Кремля. Кремация как способ уничтожения останков может напомнить о том, как обошлись с телами членов семьи Николая II после расстрела. Такое сходство косвенно подтверждает влияние Юровского и его опыта уничтожения останков при определении судьбы тела Фанни Каплан. На следующий день в газете «Известия» было опубликовано короткое сообщение:
Покушение Каплан на Ленина стало поворотным моментом в истории советской России. Уже в день покушения поздно вечером ВЦИК выпустил воззвание «Всем Советам рабочих, крестьянских, красноармейским депутатам, всем армиям, всем, всем, всем», в котором призвал сплотиться перед лицом врагов революции:
5 сентября 1918 года идею агрессии и насилия в отношении противников революции легализовало постановление Совета народных комиссаров РСФСР «Красный террор». В постановлении провозглашалась политика партийной мобилизации, изоляции и расстрела врагов революции:
«Совет Народных Комиссаров, заслушав доклад Председателя Всероссийской Чрезвычайной Комиссии по борьбе с контрреволюцией, спекуляцией и преступлением по должности о деятельности этой Комиссии, находит, что при данной ситуации обеспечение тыла путем террора является прямой необходимостью; что для усиления деятельности Всероссийской Чрезвычайной Комиссии по борьбе с контрреволюцией, спекуляцией и преступлением по должности и внесения в нее большей планомерности необходимо направить туда возможно большее число ответственных партийных товарищей; что необходимо обеспечить Советскую Республику от классовых врагов путем изолирования их в концентрационных лагерях; что подлежат расстрелу все лица, прикосновенные к белогвардейским организациям, заговорам и мятежам; что необходимо опубликовать имена всех расстрелянных, а также основания применения к ним этой меры.»
Политика красного террора выражалась в жестоком подавлении контрреволюционных выступлений и мятежей, уничтожении любых попыток сопротивления и саботажа, помещении врагов революции в трудовые лагеря, взятии в заложники представителей буржуазии и их расстрел в случае проведения антибольшевистских акций и других формах массового насилия. Эти меры не являлись особенностью большевистской политической программы. Подобные действия не менее активно практиковались в войсках и тылу как белого движения, так и иностранных интервентов.
Помимо провозглашения политики массового террора, история Фанни Каплан имела и сугубо криминологическое продолжение. Учитывая, что следствие по делу о покушении так и не было окончено, в последующее время стали появляться различные версии случившегося, как имеющие под собой фактологическую основу, так и откровенно фантастические. Здесь стоит остановиться только на тех случаях, которые обогащают или обоснованно опровергают отдельные детали преступления.