Днем 30 октября восставшие начали громить лавки на базаре, устраивать уличные беспорядки и поджоги. К базару были высланы офицерские патрули и полуроты местных полков. Затем в город для подавления восстания были вызваны несколько батальонов и полк с Русского острова. Вечером восставшие начали устраивать поджоги: сгорела Матросская слобода, военно-окружной суд, морское собрание, некоторые магазины. 31 октября восставшие, многие из которых были пьяны, захватили гауптвахту, военную тюрьму, караульный дом, разгромили их и освободили арестованных. Уже к концу дня почти весь Владивосток оказался в руках восставших. Царские войска, вызванные начальником Владивостокского гарнизона, отказались стрелять по восставшим, а часть солдат перешла на их сторону. Однако революционные организации города были слабы и малочисленны. Даже сами матросы и солдаты не имели сильного руководства, они бунтовали стихийно, громя все вокруг. Поэтому властям удалось легко подавить восстание, пообещав выполнить некоторые требования восставших и выдворив наиболее революционно настроенные части из города.
Но в декабре 1905 – январе 1906 года во Владивостоке произошло новое восстание.
Оно было вызвано введением в Приморье 6 ноября 1905 года военного положения, началом массовых арестов. 3 декабря рабочие Уссурийской железной дороги начали забастовку, захватили под свой контроль железнодорожную инфраструктуру. 6 декабря 5000 солдат и матросов устроили митинг и избрали исполнительный комитет нижних чинов Владивостокского гарнизона для координации действий всех воинских частей. Комитет предъявил коменданту Владивостокской крепости требования солдат и матросов, обозначенные на собраниях 7—12 декабря, но комендант отказался отвечать на эти требования. 9 января матросы Сибирского экипажа захватили склад с оружием. На следующий день в цирке либералы и социал-демократы устроили многотысячное собрание, где призывали солдат и матросов к дальнейшей борьбе с самодержавием. После митинга 2000 вооруженных демонстрантов решили двинуться к штабу крепости. Между ними и правительственными войсками крепости начался вооруженный конфликт.11 января восстали артиллеристы Иннокентьевской батареи. К ним присоединилась часть гарнизона города, команды нескольких кораблей флота. Они вынудили Верхнеудинский полк казаков удалиться из города, освободили арестованных, и фактически власть над городом была взята революционерами. Были организованы торжественные похороны жертв перестрелки 10 января. 26 января царские войска выдвинулись во Владивосток и подавили второе восстание. К суду было привлечено более 2000 человек, из них 29 казнены, остальные отправлены на каторгу.
И, несмотря на это, осенью 1907 года совершилось третье восстание во Владивостоке.
В апреле 1907 года была организована владивостокская группа РСДРП. Она боялась устраивать новое восстание, так как считала, что оно обречено на поражение и лишь приведет к очередной волне преследований революционеров. Эсеры все же призвали солдат и матросов к новому восстанию. Одним из поводов к нему явился приговор к смертной казни группы солдат-минеров, расправы над другими революционерами. Утром 16 октября в районе бухты Диомид минеры подняли восстание, в военном порту за ними последовали рабочие и матросы. Эти выступления были подавлены, но утром 17 октября повстанцами были захвачены миноносцы «Скорый», «Сердитый», «Бодрый» и «Тревожный». «Сердитый» и «Тревожный» вскоре были освобождены от повстанцев, а миноносец «Скорый» открыл огонь по дому губернатора и другим административным зданиям. В результате погибла одна женщина. Затем «Скорый» обстреляли правительственные миноносцы, и он был освобожден. Правительственные войска, обладая перевесом сил, опять подавили восстание; все рабочие военного порта были уволены, участников восстания судил Приамурский военно-окружной суд с 12 ноября 1907 года до 13 марта 1908 года. 46 участников восстаний были приговорены к расстрелу, остальные отправлены на каторгу или в дисциплинарные батальоны, военные тюрьмы.