Авиация, придававшаяся АВФ, за год произвела 1014 самолето-вылетов, в том числе 384 по плавсредствам в море и в портах, и 492 на разведку. Однако результативность этой работы оказалась низкой, в т. ч. из-за отсутствия истребительного прикрытия. Парадоксально, но факт – в 1942 г. авиагруппа АВФ была сильнее и в количественном и в качественном отношении. Насколько можно судить на данный момент, не удалось потопить вообще ни одного плавсредства. Наибольший успех был достигнут 30 августа. Немецкий отряд из 14 боевых единиц, выходивший к Таганрогу, слишком поздно был прикрыт истребителями и подвергся неоднократным атакам 23-го штурмового авиаполка. Причем в последнем вылете наши штурмовики сопровождались истребителями 8-й воздушной армии. В результате все 14 единиц получили повреждения, в т. ч. четыре вышли из строя.
Тем не менее постоянные попытки советской стороны воздействовать на вражеские коммуникации заставили немецкое командование предпринять ответные меры. Поскольку большая часть соединений люфтваффе с июня убыла под Курск, противник решил провести ряд набегов на базы АВФ силами надводных кораблей. Сначала замыслы врага строились на возможности уничтожения наших катеров огнем корабельной артиллерии непосредственно в базах, затем – на выманивании катеров в море и потоплении их в бою. Для этого использовались артиллерийские лихтеры в обеспечении «раумботов», катеров-тральщиков, а иногда и торпедных катеров. В ночи на 11, 14 июня, 21 июля и 1 августа проводились набеги на Приморско-Ахтарскую, в ночь на 20 июня и на 21 июля – на Ейск. Результаты обстрелов совершенно не оправдали ожиданий – самым крупным успехом стало уничтожение одного самолета МБР-2 в Ейске. В первых двух набегах на Приморско-Ахтарскую вместо базы обстреливался хутор Морозовский, находившийся далеко в стороне. Бои с вышедшими на отражение набегов катерами также не принесли успеха. В четырех боях у нас был поврежден один малый охотник, несколько катеров получили легкие повреждения. Правда, своя артиллерия и авиация по ошибке два раза повредила один и тот же охотник. Для немцев бой 21 июля у Приморско-Ахтарской чуть не закончился катастрофой. У обоих артлихтеров при обстреле порта из-за неграмотной эксплуатации вышли из строя все 88-мм орудия, и единственному «раумботу» пришлось сражаться с пятью нашими катерами. К сожалению, слабые возможности наблюдения не позволили нашему отряду обнаружить тяжелое состояние кораблей противника, бой велся на большой дистанции вплоть до израсходования боеприпасов, и немцы избежали разгрома. Тем не менее благодаря полному штилю бронекатера смогли добиться двух попаданий из танковых пушек в «раумбот» (единственный раз на данном ТВД), и после боя он был отправлен в ремонт в Николаев.
Малая мореходность артлихтеров сказалась при набеге 20 июня на Ейск. Из-за начавшегося шторма они с трудом дошли до базы, в том числе один из трех – на буксире. Кроме того, во время этого набега в Ейске случайно оказался помощник командующего ВВС ЧФ по летной подготовке Н. А. Наумов. На своей «Аэрокобре» он в одиночку связал боем четыре немецких истребителя и сбил один из них. Это позволило «Илам», несмотря на потери, прорваться к артлихтерам и нанести им повреждения пушечно-пулеметным огнем.
Кроме набегов и охраны конвоев, немецкие артлихтеры вплоть до конца октября периодически обстреливали приморский фланг 44-й армии. В наших документах сложно отделить результаты этих обстрелов от результатов вражеских артобстрелов в целом. Но, судя по малой эффективности бомбардировок теми же артлихтерами баз АВФ, успехи были скромными.
С августа немцы начали минные постановки. До этого мины не ставили, чтобы не создавать помех собственным действиям. Между 10 августа и 27 сентября были выставлены 52 донные мины в активных заграждениях, 367 якорных мин и 112 защитников в оборонительных заграждениях и 35 мин при эвакуации портов (16 у Мариуполя, 9 у Бердянска и 10 у Темрюка). Из шести активных и оборонительных заграждений пять себя вообще никак не проявили, а шестое было обнаружено лишь послевоенным тралением. Не проявило себя и заграждение у Мариуполя. В Бердянске на одной из мин погиб бронекатер. Слабые в целом результаты немецкой минной войны резко контрастируют с убийственной эффективностью Темрюкского заграждения. С октября 1943 по апрель 1944 г. на 10 минах подорвались семь катеров, пять из которых погибли. Такое стало возможным только из-за плохой организации траления.
С изменением обстановки на суше и продвижением наших войск вдоль северного побережья Азовского моря с конца августа флотилия провела серию тактических десантов. 44-я армия Южного фронта пыталась таким образом сорвать организованный отход противника, а в некоторых случаях – помочь сбить немцев с очередного рубежа. Предварительно была проведена подготовка десантников и катеров – погрузка/выгрузка, переход морем, огонь с корпостом по берегу, связь и т. д.