В феврале еженощно рейсы к малоземельскому плацдарму совершали один-два БТЩ, один-два тральщика из числа мобилизованных, от четырех до 11 сторожевых катеров, до трех буксиров (как с баржами, так и без), от четырех до восьми сейнеров, грузоподъемностью по 70–80 т и до восьми мотоботов. Последние, в зависимости от погоды, могли перевозить от 4 до 10 т груза. Роль мотоботов постоянно увеличивалась в связи с тем, что они стали использоваться в качестве переправочных средств для разгрузки более крупных судов, подойти которым к берегу мешали погодные условия или противодействие противника. С мая на базе спарок мотоботов стали сооружаться плоты для доставки танков (за май – июнь на плацдарм перевезено 37 Т-26, Т-34, «Валентайн») и тяжелых артиллерийских орудий. Участие же крупных кораблей после того, как в ночь на 28 февраля внезапной атакой «шнелльботов» были потоплены канонерская лодка «Красная Грузия» и БТЩ «Груз», почти полностью прекратилось. Всего с 15 февраля по сентябрь по этой коммуникации было перевезено на Малую Землю 17 тыс. т грузов, 58,9 тыс. человек, 37 танков, 351 орудие, 208 минометов, 25 установок РС, обратно вывезено 38,7 тыс. военнослужащих, в основном раненых. С учетом условий, в которых происходили эти перевозки, их успешное проведение можно считать значительным достижением Черноморского флота.
Объем грузов, перевезенных в течение года из Поти в Геленджик, также представлял собой внушительную цифру. В нее вошли 438,9 тыс. т военных и 86 тыс. т народно-хозяйственных грузов, 254,5 тыс. военнослужащих, 428 танков и бронемашин, 897 орудий и множество другой военной техники, обратно было вывезено 74,4 тыс. раненых. Интересно отметить, что больше половины от перечисленного (153,5 тыс. военнослужащих, 387 танков, 569 орудий и минометов) пришлось на 1-й квартал года, когда из Поти в Туапсе прибрасывались части 10-го гвардейского и 3-го стрелкового корпусов. Без этого усиления Черноморская группа войск не смогла бы вести наступательные боевые действия. Начиная с июля, в связи с вводом в эксплуатацию железных дорог и подвижного состава, объем морских перевозок резко снизился, но полностью не прекратился. Морем продолжали доставлять нефтепродукты (как для нужд войска, так и для народного хозяйства), а также снабженческие грузы для планируемых ЧФ десантных операций.
В качестве главной угрозы перевозкам изначально рассматривалась авиация противника. В 1-м квартале в зоне ответственности Новороссийской ВМБ было зафиксировано 2785 пролетов вражеских самолетов, Туапсинской ВМБ – 261 самолето-пролет, Главной ВМБ – лишь единичные случаи. Такая разница объяснялась тем, что в зоне ответственности Новороссийской ВМБ находился плацдарм на Мысхако, и учитывались все удары авиации противника, совершавшиеся по нему. Тем не менее активные действия авиации противника заставили с 18 марта осуществлять все движение на участке коммуникации Туапсе – Геленджик только в темное время суток. На остальных, расположенных далее к югу участках деятельность люфтваффе сводилась в основном к воздушной разведке, осуществлявшейся одиночными самолетами, хотя они и несли бомбовую нагрузку. Из-за ошибки поста ВНОС атакой одного из таких разведчиков 23 февраля в гавани Туапсе был потоплен транспорт «Ульянов» – единственное крупное советское судно, уничтоженное ударом с воздуха на театре в течение 1943 г. В то же время три массированных налета на этот же порт, предпринятых немцами в течение 1-го квартала, результатов не имели.
Во 2-м квартале в связи с проведением операции «Нептун» действия люфтваффе резко активизировались. В зоне НВМБ было учтено 20 698 самолето-пролетов, в зоне ТВМБ – 266, но опять же львиную их долю составляли вылеты истребителей и бомбардировщиков, вылетавшие для действий в небе над Малой Землей. Летавшие на «свободную охоту» в район Новороссийск – Геленджик истребители противника не пренебрегали ударами по катерам и малым плавсредствам, в связи с чем последние понесли чувствительные потери и были вынуждены свести свое плавание в светлое время суток к минимуму. 22 мая при попытке провести днем каботажный транспорт «Интернационал» из Туапсе в Геленджик наш конвой попал под удар 17 Ju87 и по существу был разгромлен. Судно получило попадание двух, БТЩ «Мина» – одной бомбы. Сторожевой катер № 041 затонул, БТЩ «Гарпун» ограничился осколочными повреждениями, и лишь сторожевой катер № 091 остался непораженным. После этого транспорт пришлось отбуксировать назад в Туапсе, а конвой расформировать.